Souris isogénique

[Guillaume69]

Bonsoir,

Chez la souris, j'ai remarqué dans plusieurs articles que lorsqu'on veut étudier l'influence d'un paramètre environnemental (alimentation par exemple), on utilise des lignées "isogéniques", pour limiter les variations du backgroung génétiques entre les différents individus.

Exemple : Epigenetic inheritance at the agouti locus in the mouse, Morgan, Nature 1999

C'est quoi, ces lignées isogéniques ?
Il m'a semblé qu'il s'agissait de souris d'une même portée. C'est seulement ça, ou y a t-il quelque chose de plus ?

Merci d'avance
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[TanguyE]

Bonsoir,

Ce sont des lignées qui ont exactement le même matériel génétique. Donc plus que des souris d'une même portée.

Par contre pas la moindre idée sur la façon dont on les obtient.

[Edelweiss68]

Bonsoir,

Par contre pas la moindre idée sur la façon dont on les obtient.

Apparemment, pour les premières en tout cas, elles sont issues d'une série de plusieurs générations de croisements au sein d’une même lignée entre frères et sœurs murins (endogamie).

http://www.courrierinternational.com...ut-pour-plaire

[Guillaume69]

Justement, je souhaiterais savoir si ce sont "plus" que des lignées très homogènes = celles qu'on utilise habituellement, ou pas.

Car quand on dit qu'elles ont "exactement" le même matériel génétique : non, ce ne sont ni des jumeaux (enfin des sextuplés très souvent) univitellin, ni des clones

[A voir en vidéo sur Futura]

[Topoisomerase]

salut

une lignée isogénique est une lignée homozygote à tout les loci. En gros, elles ont toutes les mêmes allèles.

Ont les obtient par backcross succesifs.

Dans ton cas elle est utile pour supprimer toute variabilitée due aux différents allèles et pouvoir observer uniquement ce qui est environemental.

[Guillaume69]

salut

une lignée isogénique est une lignée homozygote à tout les loci. En gros, elles ont toutes les mêmes allèles.

Ont les obtient par backcross succesifs.

Dans ton cas elle est utile pour supprimer toute variabilitée due aux différents allèles et pouvoir observer uniquement ce qui est environemental.

Merci de ta réponse

Aurais-tu un lien vers un quelconque cours / site / article sur l'obtention de ces lignées ?

En particulier, j'aimerais bien savoir combien de génération sont nécessaire dans la mesure où la consanguinité apporte quand même pas mal de problèmes, donc on doit pas avoir des souris très très fraîches au bout de la n-ième génération

[invite9fdbe39f]

salut

une lignée isogénique est une lignée homozygote à tout les loci. En gros, elles ont toutes les mêmes allèles.

Ont les obtient par backcross succesifs.

Dans ton cas elle est utile pour supprimer toute variabilitée due aux différents allèles et pouvoir observer uniquement ce qui est environemental.

Ici ils ont fait des croisements frère-soeur (ce qu'on fait faire aux souris...).
Je pense pas qu'on puisse obtenir ainsi 100% d'homozygotie (même si on doit en être proche après 30 croisements frères soeurs!). Calculette... après 20 croisements frères soeurs il devrait rester 0,014 % d'hétérozygotie. De même on n'obtient pas des "clones" au sens strict, il reste quelques différences, sans doute négligeables ?

Sinon, j'ai rien compris à l'article....

[Topoisomerase]

Aurais-tu un lien vers un quelconque cours / site / article sur l'obtention de ces lignées ?

http://www.isogenic.info/
un site ou tu pourra surement trouver ton bonheur.

En particulier, j'aimerais bien savoir combien de génération sont nécessaire dans la mesure où la consanguinité apporte quand même pas mal de problèmes, donc on doit pas avoir des souris très très fraîches au bout de la n-ième génération

les souris supportent très bien la consanguinité. c'est ce qui en fait un model privilégié pour beaucoup d'études en biologie cellulaire/physiologie et en génétique.

[Topoisomerase]

Ici ils ont fait des croisements frère-soeur (ce qu'on fait faire aux souris...).
Je pense pas qu'on puisse obtenir ainsi 100% d'homozygotie (même si on doit en être proche après 30 croisements frères soeurs!). Calculette... après 20 croisements frères soeurs il devrait rester 0,014 % d'hétérozygotie. De même on n'obtient pas des "clones" au sens strict, il reste quelques différences, sans doute négligeables ?

Sinon, j'ai rien compris à l'article....

je viens de survolé l'article, ils utilisent des C57bl/6 qui est une lignée "pure" déjà établie, elle est isogénique. Ils ont par la suite utilisé cette lignée pour leur construction.

En effet ils faut de nombreux croisement pour obtenir une lignée totalement homozygote par dérive génétique. on peut rendre ca plus efficace par différentes méthodes.

De plus non ce ne sont pas des clones au sens strict, ils différents déjà par leur chromosomes sexuels entre mâles et femelles et en effet il y a une petite probabilité qu'ils différent sur quelques loci. Ce qui me fait revenir sur la définition que j'ai mise sur un précédent post ou il faut un peu nuancé.