PCR dégénéré
bonjour,
On dois faire un exposé (en français) sur un article scientifique (en anglais) sur la reproduction asexuée de rotifer.
Dans l'article ils font un expérience et utilise un PCR dégénéré...
D'aprés le maigre infos que j'ai trouvé se serais de remplacer des nucléotides par d'autre pour avoir plusieurs possibilité possible de chaine d'ADN...
Si quelqu'un pourrais m'expliquer cette technique plus en détail ca m'aiderai beaucoup !!!!
d'après le peu de chose que je sais la dessus je te dirai tout d'abord qu'on parle de PCR dénégérée par rapport au fait que le code génétique est dit dégénéré.
c'est à dire qu'un même acide aminé peut être codé par différents codons.
sur ce principe on peut décider de créer des amorces PCR en partant de la protéine et non de la séquence ADN : on "traduit" en sens inverse pour passer de la séquence peptidique à la séquence nucléotidique.
mais comme le code génétique permet plusieurs solution on cré des amorces dégénérées : toutes les amorces vont coder pour les mêmes acides aminés mais leurs séquences sont différentes, par un ou plusieurs nt...
voila, j'espère que j'ai été plus ou moins clair et que surtout je n'ai pas dit de grosse bétise étant donné que je ne suis pas spécialiste en la matière
aaah ouais... C'est plus clair comme ça.... Je comprend mieux !
merci beaucoup !
de rien
Encore une questions dans l'article ils parlent de site (sur le génome) quatre fois dégénéré ? qu'est ce que ça veux dire ?
voici le traduction du passage par google:
"En tant que
mesure de la différence neutre dans les régions codantes,
nous avons utilisé le pourcentage de différence non corrigée
à quatre fois dégénéré sites, ici désigné D4,
une quantité qui est plus lente à saturer et moins
sensibles à la polarisation de transition que sont transversion
différences à double et triple dégénérés
sites (31). Pour les gènes examinés, 11 à 18% des
tous les sites de codage sont quatre fois dégénéré."
voici l'original:
"As a
measure of neutral difference in coding regions,
we used the uncorrected percentage difference
at fourfold degenerate sites, here designated D4,
a quantity that is slower to saturate and less
sensitive to transition-transversion bias than are
differences at twofold and threefold degenerate
sites (31). For the genes examined, 11 to 18% of
all coding sites are fourfold degenerate."
