Question sur le ΔCt
Bonjour à tous,
J'ai une petite question sur le ΔCt et le 2-ΔCt.
Après avoir réalisé une RT-qPCR, j'ai obtenu les Ct de mes différents échantillons. Je souhaite mntn analyser les résultats et pour cela, je veux calculer les ΔCt dans un premier temps la formule est donc :
ΔCt(A) = Ct (A) - Ct (Ref)
Mais qu'en est il pour le ΔCt de reference ? Il est de 0 ? Si oui, comment fait on alors pour calculer le 2-ΔCt ?
2-ΔCt (A) = ΔCt (A) - ΔCt (Ref)
Quelqu'un peut m'éclairer ?
Hello,
Tu peux donner plus de précisions sur ce que tu veux faire ?
Tu n'as pas forcément besoin de...
Si si je dois le calculer, c'est demandé par mon directeur de labo !
Bonjour
je ne suis pas sûre d'avoir bien compris ta méthode (j'ai l'impression que tu appelles Ref aussi bien l'échantillon qui sert de contrôle et le gène que tu prends comme référence pour normaliser). je t'explique comment je fais:
1/ calcul du ΔCtcible = Ctcible (échantillon test) - Ctcible (échantillon contrôle)
2/ calcul du ΔCtref = Ctref(échantillon test) - Ctref (échantillon contrôle)
3/ ΔΔCt = ΔCtcible - ΔCtref
4/ 2 puissance (-ΔΔCt) = taux d'expression de ta cible dans ton échantillon test par rapport à ton échantillon contrôle (ou il vaut 1), normalisé par rapport à ton gène de référence
