[Microbiologie] détermination nombre paires de bases en electrophorese
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détermination nombre paires de bases en electrophorese



  1. #1
    inviteed9b04da

    détermination nombre paires de bases en electrophorese


    ------

    Bonjour,

    je voudrais savoir s'il existait une formule pour calcul le nombre de paires de bases des bandes de fragments électrophorétiques en fonction de la distance de migration.
    Il me semble que log(taille)=1/d.
    Cependant, je ne comprend pas mes résultats qui sont tjs compris entre 1,02 et 1,09.
    d est elle exprimé en cm?
    Merci d'avance pour vos réponses.
    Bonne journée.

    -----

  2. #2
    Edelweiss68

    Re : détermination nombre paires de bases en electrophorese

    Bonjour,

    Vous avez des marqueurs de taille ? Vous avez tracé une droite ?

    Cela peut peut-être vous aider : http://www.snv.jussieu.fr/bmedia/ATP/bioch1.htm
    H u m a n i t y

  3. #3
    inviteed9b04da

    Re : détermination nombre paires de bases en electrophorese

    Merci, j'ai déjà lu ce cours.
    Ceci dit, ils utilisent des logiciels.
    Ma question repose sur la lecture d'un gel sans logiciels.
    Les résultats que j'ai trouvé sont ceux du marqueur de taille.
    Merci quand même!

  4. #4
    invitef31aae78

    Re : détermination nombre paires de bases en electrophorese

    slt!
    comme te la dit edel tu trace la droite étalon log(marqueur)=f(distance de migration).
    puis tu report la distance de migration de ton fragment sur la droite et tu lit sur les ordonnées la taille.
    attention il faut bien pensé à convertir ce que tu lis sur les ordonnées en paire de base (10^x) x étant ce que tu as lu sur les ordonnées.
    attention aussi si c'est kpb à convertir en pb en multipliant par 10^3.
    sa peut parfois induire en erreur.

    j'éspère t'avoir aider.

  5. A voir en vidéo sur Futura
  6. #5
    invitef31aae78

    Re : détermination nombre paires de bases en electrophorese

    précision la distance tu peux l'exprimé en cm ou en mm sa na pas trop d'influence. il faut juste pensé à utilise la même unité dans la droite étalon et dans tes fragments d'adn. elle se lit du haut du gel vers le bas dans le sens de migration. le zéro étant le haut (endroit du dépôt). elle peut aller jusqu'à 10 cm ou plus selon la longueur du gel et le temps de migration.

  7. #6
    inviteed9b04da

    Re : détermination nombre paires de bases en electrophorese

    Merci beaucoup pour toutes ces informations.
    Sincèrement.
    A très bientôt sur le site.
    Cdt.

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