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recherche d'opéron dans une séquence nucléotidique



  1. #1
    feps

    recherche d'opéron dans une séquence nucléotidique

    Bonjour,
    je cherche des logiciels de bioinformatique qui me permettent de chercher les opérons , les promoteurs ainsi que les séquences 5' et 3' UTR dans une séquence nucléotidique chez les procaryotes.
    j'aimerai bien savoir en détail comment on peut procédre pour identifier ces séquences régulatrices à partir de donnée de séquençage du génome complet.
    Je vous remercie pour vos éventuelles réponses et vous souhaite un bon week end.

    -----


  2. #2
    gorben

    Re : recherche d'opéron dans une séquence nucléotidique

    salut

    Pour rechercher un operon, le plus simple est de le faire avec des outils bioinfo disponible sur le net inbiogen. Tu recherches les differents ORF de ta sequence, si des ORF sont trés proches tu recherches en amont de chacune un promoteur... et tu auras tes eventuels operons (1 promoteur pour 2 à 5 genes).

    Chez les procaryotes, a la difference des eucaryotes, les sequences 3' ou 5' UTR sont trés courtes.

    Les sequences regulatrices sont trés diffcilles à trouver si tu ne sais pas exactement quoi chercher.

    a+

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