Fragilisation d'une paroi de champignon

[invite3f22fed4]

bonjour,
je vous explique mon petit soucis. je bosse actuellement sur un champi qui s'appelle Serpula lacrymans en gros notre bien aimée mérule petit champi qui se nourrit de la cellulose du bois et le fragilise: bonjour la baignoir dans la cuisine par exemple.
j'essaie d'extraire l'ADN des spores de ma petite bete mais rien y fait donc s'il y a des gens qui pourrait me donner des pistes plutot enzymatiques pour fragiliser voir détruire la paroi d'une spore de champignons je suis préneuse.
cordialement
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[Alixouninette]

je dirais que si tu utilises des enzymes, le risque est que tu dénatures ton ADN.
Pourquoi tu laisserais pas germer ta spore pour ensuite récupéré son ADN? Ca sera alors plus facile de le récupéré sous une autre forme que sporique. Non ?

[invite3f22fed4]

bonjour,
en effet ça serais plus simple mais cette souche est difficile à faire germer il faut environ 2 à 3 mois pour qu'elle germe d'où l'intéret de pouvoir récuperer son ADN avant qu'elle germe. Je sais bien que le risque de dégradation de l'ADN est important en utilisant des enzymes mais je pense que c'est une bonne solution.
merci quand même.

[kamor]

J'ai travaillé sur des Penicillium il y a quelques années de cela et on utilisait un kit d'extraction d'ADN fongique de chez... Sigma je crois. Mais bon, les rendements avaient l'air ridicule, vous aurez peut être besoin d'optimiser le protocole suivant la paroi de vos spores. Faudrait que je déterre mon rapport.
Sinon la lyse mécanique par billes pourrait peut être t'aider, si vous avez dans ton labo un appareil qui agite fortement (genre un Bead beater).

[A voir en vidéo sur Futura]