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Fréquences + loi de Hardy-Weinberg



  1. #1
    jojok10

    Fréquences + loi de Hardy-Weinberg


    ------

    Bonjour,

    j'ai un exercice de génétique et je ne suis pas sur d'avoir juste sur certain point.Pourriez vous m'aider svp?merci

    Un séquençage du locus Bald chez 1000 souris prises au hasard dans la population donne
    les résultats suivants :
    - 490 individus b+/ b+
    - 500 individus b1/ b+
    - 10 individus b1/ b1

    1)Calculez les fréquences génotypiques et phénotypiques dans cette population.

    2)Testez si cette population respecte les proportions génotypiques de Hardy-Weinberg pour ce locus.



    1)fréquence phénotypique :

    f(b+b+)=490/1000=0,49
    f(b1b+)=500/1000=0,50
    f(b1b1)=10/1000=0,01

    fréquence génotypique???

    2)il faut faire un test X² :

    Pour b+b+ : fréquence allélique p²
    Pour b1b+ : 2pq
    Pour b1b1 : q²

    f(b+b+)=X=0,49
    f(b1b+)=Y=0,50
    f(b1b1)=Z=0,01

    p=X + Y/2 = 0,49 + 0,50/2=0,74
    q=Z + Y/2 = 0,01 + 0,50/2=0,26

    On calcul les effectif attendu:

    b+b+ : (0,74)² x 1000=547,6 effectif observé (eo) : 490
    b1b+ : 2(0,74x0,26) x 1000=384,8 eo : 500
    b1b1 : (0,26)² x 1000=67,2 eo : 10

    on calcul X² :

    X² = somme (obs-th)²/th

    ce qui nous donne X²=89,22

    ensuite on doit comparé à la table des valeurs du test X² mais le soucis c'est qu'elle s'arrete jusqu'a 30.
    j'ai pratiquement le même exercice en corrigé mais eux il trouve une valeur de X² = 8,51 donc mon truc sa fait vraiment beaucoup.
    il doit y avoir une erreur

    -----

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  4. #2
    Guillaume69

    Re : Fréquence

    Tu as calculé les fréquences génotypiques là...
    Les fréquences phénotypiques, tu les connaîs en sachant quel allèle est récessif/dominant, ou s'il y a co-dominance.

    Ton calcul de khi2 a l'air juste (j'ai pas pris ma calculatrice)
    Si c'est "pratiquement" le même exercice mais pas le même, alors ça ne m'étonne pas que ce soit différent.

    Dans ta table, tu dois regarder le khi2 pour un degré de liberté donné, que tu dois calculer (je suppose qu'ici il est de 1, mais je me rappelle plus de la formule donc à toi de voir).
    Si ton paramètre est au dessus de cette valeur seuil => le locus ne suit pas la loi de HW.
    Dernière modification par Guillaume69 ; 15/11/2011 à 14h45.

  5. #3
    jojok10

    Re : Fréquence

    Je ne sais pas calculer les fréquences phénotypique...

    Oui mais un X² 10x plus que un autre c'est étrange.Oui c'est un ddl de 1.Dans ma table je n'ai aucune valeur correspondant a 89,22 ...

  6. #4
    Guillaume69

    Re : Fréquence

    Non, ce n'est pas étrange, si jamais les données font que c'est le cas. Si tu as tapé comme il faut sur ta calculatrice et que tu obtiens cette valeur, elle n'a pas de raison d'être fausse.

    Ta table donne les valeurs limites de khi2, pour un alpha donné et un ddl donné.
    Si tu es en dessous => hypothèse nulle non rejetée , si tu es au dessus => hypothèse nulle rejetée (avec un risque alpha).

    Là tu es au dessu => hypothèse rejetée. Loi de HW non suivie.


    Pour calculer les fréquences phénotypiques, il faut savoir quel génotype donne quel phénotype.
    Exemple avec les groupe sanguins
    Si j'ai dans un échantillon
    f(O/O) = 0.2
    f(O/A) = 0.1
    f(A/A) = 0.15
    alors la fréquence du phénotype [A] est : 0.1+0.15 = 0.35 puisque
    la fréquence du phénotype [O] est 0.2
    Tu comprends donc qu'il faut connaître les relations de dominance/récessivité de tes allèles si tu veux répondre à la question.

  7. A voir en vidéo sur Futura
  8. #5
    jojok10

    Re : Fréquence

    je pense avoir compris,dans mon exercice :

    f[b+]=0,49+0,50=0,99
    f[b1]=0,50+0,01=0,51

    c'est ca?

  9. #6
    Guillaume69

    Re : Fréquence

    Non, ce n'est pas possible que le même génotype (b+/b1, fréquence 0.50) donne deux phénotypes différents !

    C'est pour cela que je disais : il faut savoir le phénotype de b+/b1. Soit c'est [b+], soit c'est [b-], ça peut pas être les deux.

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