Technique pCR choix amorces

[inviteed4c160a]

bonjour,
j'ai besoin d'un coup de pouce sur un exercice de PCR.

On doit réaliser une amplification par pCR d'une séquence ADN présentée partiellement dans le sens 5'-3'.
TATCATGCCTCTTTGCACCATTCTAAAGAA TAACAGTGATAATTTCTGGGTTAAGGCAAT AGCAATA------//--------ACTAAAAAGGGAATGTGGGAGGTCAGTGCA TT

Il faut pour cela choisir la meilleure amorce parmi les propositions suivantes:
A) 5'-GGAATGTGGGAGGTCAGTGCATT-3' et 5'-AATGCACTGAAATGCACTGAT-3'
B) 5'-GGAATGTGGGAGGTCAGTGCATT-3' et 5'-AATGCACTGACCTCCCACATTC-3'
C) 5'-TATCATGCCTCTTTGCACCATTCT-3' ET 5'-AATGCACTGAAGGTCAGTATC-3'
D) 5'-TATCATGCCTCTTTGCACCATTCT-3' ET 5'-AATGCACTGACCTCCCACATTC-3'
E) 5'-ACTAAAAAGGGAATGTGGGAGGT-3' et 5'-ATGCCTCTGTGGGAATTCATC-3'

Je sais qu'il ne faut pas de complémentarité entre amorce et d'appariement intrabrin et au minimum 50% de GC mais je ne vois pas laquelle est la mieux.

Merci de votre aide

a bientôt.
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[invite032bb3be]

c'est le brin + que tu as représenté ? si c'est le cas je pense que les meilleures amorces sont celles de l'item D (la premiere se lit dans le meme sens que le brin et la seconde est complémentaire au brin + et se lit dans le sens inverse)

[invite853321bf]

peut être qu'en regardant cette animation très bien faite sur le principe de la PCR, le choix du bon couple te paraitra plus simple

[inviteed4c160a]

Alors oui en réfléchissant à tête reposé, c'est la D

Sympa l'animation. C'est bien expliqué.

Merci encore

[A voir en vidéo sur Futura]