Amorces de PCR

[invite6b9cc6ba]

Salut ! J'aurais une question au sujet des amorces; on dit qu'elles contiennent généralement environ 20 bases, ma question est : pourquoi pas moins que ça?
Merci !
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[Edelweiss68]

Nouvelle discussion créée, merci de ne pas faire remonter de fil trop ancien.

[Edelweiss68]

Bonsoir et bienvenue sur FS,

Avec moins d'une vingtaine de nucléotides vous perdez en spécificité. C'est un compromis.

[invite6b9cc6ba]

Bonsoir et bienvenue sur FS,

Merci bien ! Et je m'excuse !

Avec moins d'une vingtaine de nucléotides vous perdez en spécificité. C'est un compromis.

D'accord ! mais je ne saisis pas ce qui nous permet de dire qu'à précisément 20 bases, il y a une spécificité...

[A voir en vidéo sur Futura]

[Edelweiss68]

D'accord ! mais je ne saisis pas ce qui nous permet de dire qu'à précisément 20 bases, il y a une spécificité...

Ce n'est pas soudainement à 20 nucléotides qu'il y a une spécificité, c'est une moyenne acceptable étant donné le nombre de possibilités d'enchaînement d'une vingtaine de nucléotides.

[Edelweiss68]

Pour compléter, la taille des amorces dépend de la complexité du génome.

Voir cet exercice (Correction)

[invite6b9cc6ba]

J'ai compris ! merci beaucoup ^^

[inviteb3a6feac]

Bonjour,

On peut également ajouter qu'avec plus de 20nt, ou plus de 30 va-t-on dire, car j'utilise parfois des 24nt aussi, on perd en efficacité de ligation et cela alourdit la facture des amorces aussi ^^