Bonjour à tous,
Je me décide enfin à poser ma question sur ce forum car je nage un peu.
J'ai un exercice où il faut amplifier une région d'une séquence d'ADN et je dois choisir quels oligonucléotides utiliser parmi un choix de 4. (entre parenthèse la région à amplifier)
Voici mes données :
5' ---- GG AAA TCT GTG GGC ATT GTG ACC ACC ACG AGA GTG AAC CAT GCC ACC CCC AGC GCC (GCC TAC GCC CAC TCG GCT GAC CGG GAC TGG TAC TCA) GAC AAC GAG ATG CCC CCT GAG GCC TTG AGC CAG GGC TGT AAG GAC ATC GCC TAC CAG CTC ATG CAT AAC ATC AGG GAC ATT --- 3'
Voici le choix pour les 4 oligonucléotides :
a) 5' GGAAATCTGTGGGCATTGTG 3'
b) 5' ATGCATAACATCAGGGACATT 3'
c) 5' AATGTCCCTGATGTTATGCAT 3'
d) 5' CACAATGCCCACAGATTTCC 3'
Pour commencer j'ai écrit le brin complémentaire à ce brin, mais aucun amorce ne correspond, j'ai essayé de les placer dans tous les sens 5'-->3', 3'-->5' rien ne marche!
lors soit mon année de licence est trop vieille (pourtant je ne suis pas encore un fossilesoit j'ai omis un détail important)
Merci bcp pour vos pistes de réflexion
Bonne après-midi à tous
-----