probléme d'orientation des deux brins

[invite02f10cc8]

bonjour
voila mon exrcice
soit une squence de bases présente sur un brin d'ADN _brin 1_
GACTTACACGCGATTTTATATAGC
recopiez cette squence et ecrivez la séquence de brin d'ADN complémentaire
sachant que l'ARNm issu de la transcription de ce fragment d'ADN code le début d'une proteine
determiner quelle est le brin matrice justifier votre réponce et ecriver la séquence de l'ARNm
orienter la séquence toute les sequence des acide nucléique



mon problème c'est l'orientation seulement
aider moi s'il vous plait j'ai un examen la semain prochaine

et merci avance
-----

[invite02f10cc8]

Je suis en attente de vos aide

[invite02f10cc8]

Je suis en attente de vos aide s'il vous plait

[Yoyo]

salut

comme tu sais que le fragment code le debut d'une protéine, tu devrais trouver un codon ATG. donc le sens tu le trouveras selon la presence de l'ATG.

Yoyo

[A voir en vidéo sur Futura]

[invite02f10cc8]

merci pour votre réponse
voila moi j'ai fai comme ca
pour le brin complémentaire
GACTTACACGCGATTTTATATAGC brin 1
CTCAATGTGCGCTAAAATATATCG brin 2 (brin complémentaire)
alors vous avez dit j'ai cherché le codant initiateur ATG et j'lai trouvé dans le brin 2 (brin complémentaire)
et pour l'orientation moi j'ai orienté les deux brins comme ca
3'GACTTACACGCGATTTTATATAGC5' brin 1
5'CTCAATGTGCGCTAAAATATATCG3' brin 2 (brin complémentaire)

et en fin l'ARNm
il ya une chose je n'arrive pas a comprendre
je sais que la transcription débute a parire du codant initiateur ATG mais dans cet exercice le codant initiateur il est au milieu alors ma question est ce que je comence la transcription a partire de ATG c'est a dire j'ecrit comme ça
5'CTCAATGTGCGCTAAAATATATCG3'

5' AUGUGCGCUAAAAUAUAUCG3'

ou bien je transcrit toute la séquence de début jusqua la fins c a d


5'CTCAATGTGCGCTAAAATATATCG3'
5'CUCAAUGUGCGCUAAAAUAUAUCG3'

et merci avance

[invite02f10cc8]

salut

comme tu sais que le fragment code le debut d'une protéine, tu devrais trouver un codon ATG. donc le sens tu le trouveras selon la presence de l'ATG.

Yoyo

merci pour votre réponse
voila moi j'ai fai comme ca
pour le brin complémentaire
GACTTACACGCGATTTTATATAGC brin 1
CTCAATGTGCGCTAAAATATATCG brin 2 (brin complémentaire)
alors vous avez dit j'ai cherché le codant initiateur ATG et j'lai trouvé dans le brin 2 (brin complémentaire)
et pour l'orientation moi j'ai orienté les deux brins comme ca
3'GACTTACACGCGATTTTATATAGC5' brin 1
5'CTCAATGTGCGCTAAAATATATCG3' brin 2 (brin complémentaire)

et en fin l'ARNm
il ya une chose je n'arrive pas a comprendre
je sais que la transcription débute a parire du codant initiateur ATG mais dans cet exercice le codant initiateur il est au milieu alors ma question est ce que je comence la transcription a partire de ATG c'est a dire j'ecrit comme ça
5'CTCAATGTGCGCTAAAATATATCG3'

5' AUGUGCGCUAAAAUAUAUCG3'

ou bien je transcrit toute la séquence de début jusqua la fins c a d


5'CTCAATGTGCGCTAAAATATATCG3'
5'CUCAAUGUGCGCUAAAAUAUAUCG3'

et merci avance

[Yoyo]

Bonjour

La transcription ne démarre pas à un codon ATG! c'est la traduction !!! ce n'est pas du tout la meme chose.
Deplus un ARNm ne commence pas par un ATG, il y a toujours des régions non traduites au début et a la fin d'un ARNm.

YOyo

[invite02f10cc8]

Bonjour

La transcription ne démarre pas à un codon ATG! c'est la traduction !!! ce n'est pas du tout la meme chose.
Deplus un ARNm ne commence pas par un ATG, il y a toujours des régions non traduites au début et a la fin d'un ARNm.

YOyo

merci beaucoup
maintenant j'ai bien compris

oui oui c'est vrai c'est la traduction qui commence a partir d'un codant initiateur ATG
alors la réponse normalement c'est comme ca
3'GACTTACACGCGATTTTATATAGC5' brin 1
5'CTCAATGTGCGCTAAAATATATCG3' brin 2 (brin complémentaire)

5'CUCAAUGUGCGCUAAAAUAUAUCG3' ARNm


maintenant je voudrai seulement connaitre les cas d'orientation
par exemple s'ils m'ont donné une séquence comme ca
_________________ATG ou bien GTA_________________

pour l'orientation
moi je vais répondre comme ca
5' _________________ATG3'

3'GTA_________________5'

est ce que ca c'est vrai ??? et existent-ils d'autres cas?

merci encore fois
vous étés très gentille

[Meiosis]

Bonjour,

Il y a une petite erreur.

3'GACTTACACGCGATTTTATATAGC5' brin 1
5'CTCAATGTGCGCTAAAATATATCG3' brin 2 (brin complémentaire)

La troisième base (par abus de langage nucléotide) du brin complémentaire est "G" et non "C".

Sinon ça a l'air bon, la traduction débute au codon AUG correspondant au triplet ATG.

Pour connaître l'orientation c'est simple, soit on te donne une séquence d'ADN orientée.
Le brin complémentaire est orienté inverse car les deux brins d'ADN sont anti-parallèles, exemple :

5' ATAC[...]TCC 3'

le brin complémentaire sera orienté

3' TATG[...]AGG 5'

puis ensuite l'ARNm sera orienté de la même manière que le brin d'ADN transcrit puisqu'il en est la copie, seul le brin complémentaire ARN sera orienté inverse de l'autre brin ARN car ils sont aussi anti-parallèles (ici il s'agit du brin complémentaire d'ADN)

donc on a avec notre exemple :

3' UAUG[...]AGG 5'

À noter qu'à chaque fois tu peux orienter le brin à l'inverse mais en commençant à lire de la droite vers la gauche dans ce cas-là, par exemple pour le brin d'ADN complémentaire, on peut l'orienter de 5' vers 3' de cette façon :

5' GGA[...]GTAT 3'

Soit on ne te donne pas l'orientation du brin initial d'ADN et là c'est à toi de la déterminer.

[Meiosis]

Donc pour déterminer l'orientation du brin d'ADN s'il n'est pas donné il faut savoir que le brin transcrit est toujours orienté 5' vers 3'.

[Meiosis]

À noter que l'ARN est le plus souvent présent sous forme de simple brin donc on en rencontre rarement sous forme double brin (exemple des virus à ARN double brin rotavirus).

[invite02f10cc8]

Donc pour déterminer l'orientation du brin d'ADN s'il n'est pas donné il faut savoir que le brin transcrit est toujours orienté 5' vers 3'.

bonsoir merci beaucoup pour vos explications
J'ai commencé à comprendre

donc je confirme a partir de votre premier exemple que le brin matrice (non transcrit ou sens ) toujours comporte le codon initiateur ATG


comme par exemple
CATTTGA________GGA

Le brin complémentaire est comme ca

GTAAACT________CCT

maintenant pour faire l'orientation je cherche le codon ATG dan l'un des deux brin

j'lai trouvé dans ce brin GTAAACT________CCT mais sous forme de GTA alors ce brin est le brin sens
et l'orientation cava etre comme ca
5'CATTTGA________GGA3' brin 1
3'GTAAACT________CCT5' brin 2
3'GUAAACU________CCU5'




merci encore fois

[Meiosis]

Oui voilà, il faut repérer le triplet (et non le codon) ATG dans la séquence d'ADN (il est présent dans l'un des deux brins).
Une fois trouvé on oriente de 5' vers 3' et donc naturellement l'autre brin qui ne comporte pas le triplet ATG sera orienté 3' vers 5'
Puis après concernant l'ARNm il est toujours orienté 5' vers 3' donc c'est bon.

Je crois que ça se passe comme ça, à confirmer quand même.

J'ai trouvé un contre-exemple de ce qu'on est en train de dire donc je ne sais plus trop : http://step.ipgp.jussieu.fr/images/8...omineraux4.pdf

[invite02f10cc8]

Oui voilà, il faut repérer le triplet (et non le codon) ATG dans la séquence d'ADN (il est présent dans l'un des deux brins).
Une fois trouvé on oriente de 5' vers 3' et donc naturellement l'autre brin qui ne comporte pas le triplet ATG sera orienté 3' vers 5'
Puis après concernant l'ARNm il est toujours orienté 5' vers 3' donc c'est bon.

Je crois que ça se passe comme ça, à confirmer quand même.

J'ai trouvé un contre-exemple de ce qu'on est en train de dire donc je ne sais plus trop : http://step.ipgp.jussieu.fr/images/8...omineraux4.pdf

maintenant j'ai commencé a comprendre un peu
merci beaucoup pour vos aides

[Meiosis]

maintenant j'ai commencé a comprendre un peu
merci beaucoup pour vos aides

Attention quand même dans le lien que j'ai donné l'orientation n'est pas la même et je ne sais pas pourquoi.
Si quelqu'un pouvait éclaircir la situation ce serait bien.

[invite02f10cc8]

Attention quand même dans le lien que j'ai donné l'orientation n'est pas la même et je ne sais pas pourquoi.
Si quelqu'un pouvait éclaircir la situation ce serait bien.

bonjour
hier
nous avons traités un seul cas d'orientation c'est a dire le triplet ATG mais il nous reste celui de GTA parce que je sais que il y a une différence entre les deux alors je vais essayer de chercher pour mieux comprendre

je vous remercie pour votre patience avec moi

[Meiosis]

Bonjour,

Le codon initiateur qu'il faut chercher ce n'est pas plutôt AUG soit TAC ? Et non ATG ?

[Meiosis]

Ah non au temps pour moi, c'est le brin non transcrit qui comporte ATG et le brin transcrit comporte TAC.
Je corrige une erreur que vous avez faite, le brin matrice n'est pas le brin non transcrit ! C'est le brin transcrit.

[invite02f10cc8]

Ah non au temps pour moi, c'est le brin non transcrit qui comporte ATG et le brin transcrit comporte TAC.
Je corrige une erreur que vous avez faite, le brin matrice n'est pas le brin non transcrit ! C'est le brin transcrit.

bonsoir
nous sommes mis d’accord ce qui concerne le brin non transcrit comporte ATG et le brin transcrit comporte CAT ici c'est bon
et pour le brin matrice c'est vrai vous avez raison Le brin transcrit, ou brin matrice, est le brin d'ADN qui est utilisé pour effectuer la transcription c'est a dire le brin qui comporte le brin TAC
et si vous trouverez une chose concernant l’orientation pour les fragments qui contiennent GTA fait moi signe

merci

[Meiosis]

Bonjour,

Tout ce que je peux dire c'est que le brin simple d'ARN est toujours de même séquence (à l'exception des T remplacés par des U) et de même orientation que le brin non-transcrit (ou codant) d'ADN.
Donc le brin d'ARNm est orienté inverse du brin transcrit car il est anti-parallèle.

Donc si on a le brin transcrit d'ADN ça donne déjà une indication sur l'orientation et la séquence du brin d'ARNm.

[invite02f10cc8]

Bonjour,

Tout ce que je peux dire c'est que le brin simple d'ARN est toujours de même séquence (à l'exception des T remplacés par des U) et de même orientation que le brin non-transcrit (ou codant) d'ADN.
Donc le brin d'ARNm est orienté inverse du brin transcrit car il est anti-parallèle.

Donc si on a le brin transcrit d'ADN ça donne déjà une indication sur l'orientation et la séquence du brin d'ARNm.

oui c'est comme ca
et merci pour toute vos indications

[Meiosis]

Je rajoute que sens de lecture d'un brin et orientation sont différents.
Un brin peut par exemple être orienté 3' vers 5' mais être lu soit 5' vers 3' soit 3' vers 5' ce qui n'est pas la même chose.

J'avoue ne pas comprendre la correction de cet exercice : http://step.ipgp.jussieu.fr/images/8...omineraux4.pdf (en page 2)

le brin d'ARN m est toujours lu par les ribosomes dans le sens 5' vers 3', seulement si on le lit dans ce sens on tombe sur un codon GUA.
Et si on lit dans le sens 3' vers 5' on tombe sur le codon d'initiation AUG (ce qui est logique).

Donc je ne sais pas trop pourquoi on tombe sur le codon GUA au lieu de AUG.

Si tu sais me l'expliquer fais-moi signe, ça éclaircira beaucoup de choses.

[invite02f10cc8]

alors comme vous avez dit par exemple pour un brin orienté 3' vers 5' peut etre lu dans le sens 5' vers 3' exemple
3'TAA------CTG5' brin 1
5'GTC------AAT3' brin1 C'est la méme chose

mais pour différencie le brin transcrit de celui non transcrit il faut reperer le triplet ATG OU GTA ET quant tu trouve l'un de ces deux triplet dan un brin alors c'est a dire ce brin est celui de brin non transcrit et il ne faut pas baser sur l'orientation par exemple dans cet brin GTATTA------ACT alors comment on fait l'orientation ici
alors il faut remarquer que letripet ATG et sous forme GTA si on lit de l'agauche vers la droite alors pour faire l'orientation normalement c'est comme ca
3'GTATTA-----ACT5' brin non transcrit

5'CATAAT----TGA3' brin transcrit

et pour l'ARNm a la meme structure que le brin non transcrit mais U remplace T

3'GUAUUA-----ACU5'
REGARDEZ CE EXERCICE 5 celui de tableau http://www.chusa.jussieu.fr/disc/PCE...BM_2011-12.pdf
et pour cet exercice on a fait la correction et je suis sur
alors moi a partir de cet exercice j'ai tiré une conclusion que il y a plusieurs cas pour l'orientation et voila les cas
3'GTA________5'
5'________ATG3'
3'________GTA5'
5'ATG________3' et pour les cas c'était ma conclusion je ne suis pas sur
merci

[Meiosis]

Décidément je ne comprends plus rien.

J'espère que vous avez compris, ce n'est pas mon cas.

[invite02f10cc8]

Décidément je ne comprends plus rien.

J'espère que vous avez compris, ce n'est pas mon cas.

oui normalement j'ai compris pour deux cas

mais est ce que vous avez vu l'exercice

[Meiosis]

oui normalement j'ai compris pour deux cas

mais est ce que vous avez vu l'exercice

Non je n'ai pas vu ce genre d'exercices, je m'entraine chez moi en fait pour m'avancer mais je ne comprends pas grand chose..

[invite02f10cc8]

Non je n'ai pas vu ce genre d'exercices, je m'entraine chez moi en fait pour m'avancer mais je ne comprends pas grand chose..

ah ok en tout les cas moi je suis sur pour la correction de cet exercice parce qu’on a fait a l'université

[Meiosis]

ah ok en tout les cas moi je suis sur pour la correction de cet exercice parce qu’on a fait a l'université

Bonne chance pour la suite alors.
De mon côté je vais essayer de comprendre, c'est pas gagné !

[invite02f10cc8]

Bonne chance pour la suite alors.
De mon côté je vais essayer de comprendre, c'est pas gagné !

merci
a vous méme
espérons la réussite