Contrôle Qualité ARN
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Contrôle Qualité ARN



  1. #1
    invite0dfe5571

    Question Contrôle Qualité ARN


    ------

    Bonjour à tous,

    Quelqu'un pourrait-il m'expliquer en quoi consiste exactement le RIN (ratio integrate Number) lorsque l'on contrôle la qualité de nos ARN avant de faire une rétrotranscription pour un séquençage. Je sais que le RIN doit être supérieur à 8.5 mais je ne vois pas exactement à quoi il consiste contrairement aux Do 260/280, 260/230 et le ration 28S/18S. Merci d'avance pour vos réponses.

    Bonne soirée à tous

    -----

  2. #2
    Gordak

    Re : Contrôle Qualité ARN

    Salut

    Le RIN est un nombre qui est généré à partir d'une distribution, qui est la quantité d'ARN en fonction du temps qui est détectée sur ton gel. Cette distribution (ou profil) est utilisée pour quantitfier la dégradation de l'ARN. Avant, les ratios 28S/18S d'ARNr étaient utilisés, parfois d'autres méthodes. Afin de normaliser la quantification de la dégradation de l'ARN, le RIN a été développé. Il se calcule grâce à un algorithme, qui prend comme entrée la distribution et qui en ressort un nombre entre 1 et 10. Ce nombre sera grand si l'ARN est peu dégradé.

    Pour plus d'information: RIN (pdf)

    Gordak
    Dernière modification par Gordak ; 18/09/2012 à 19h22.

  3. #3
    invite0dfe5571

    Re : Contrôle Qualité ARN

    Merci beaucoup pour ton aide précieuse

    Cécile

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