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qu'est ce qu'une collection d'EST



  1. #1
    petitelectron

    Exclamation qu'est ce qu'une collection d'EST

    Bonjour,

    Je ne vois pas ce qu'est et à quoi sert un EST ?

    Si j'ai bien compris, il s'agit d'un outil de séquençage à partir d'ADNc ... Ceci permet de séquencer les gènes exprimés (?)
    Pourquoi parle t on de deux types d'EST (5' et 3'), s'agit il en fait d'amorces ?

    Si quelqu'un pourrait m'expliquer le cheminement de cette technique et le but ce serait très sympa.

    Merci

    -----


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  3. #2
    chamouulox

    Re : qu'est ce qu'une collection d'EST

    Si je ne me trompe pas, la collection d'EST c'est une collection de cDNA (obtenue par RT des ARNm transcrits dans une cellule donnée, dans des conditions donnée).

    Jamais entendu l'expression d'EST 5' et 3' désolé.

    Cham

  4. #3
    Moustik34

    Re : qu'est ce qu'une collection d'EST

    Je pense que tu pourras trouver toutes les réponses dans ce site :
    http://ead.univ-angers.fr/~jaspard/P.../4EST/1EST.htm
    je le trouve complet et assez clair.

  5. #4
    Switch31

    Re : qu'est ce qu'une collection d'EST

    en fait c'est très simple : les EST ou express sequence tag sont des petits fragments de séquences exprimées et vu que dans les banques de séquences tu n'as pas d'ARNm mais des ADNc correspondants à ceux-ci, les EST sont tout simplement des petits "morceaux" de ces ADNc ; et en fait les EST5' sont des EST obtenus au niveau de la partie 5' du ADNc et les 3' à partir du 3' de l'adnC, pour info tu retrouveras bcp plus d'EST 3' que 5' car en fait beaucoup d'ARNm qui ont été Rtranscrits en ADNc ont été "capturés" par leur queue polyA (en 3' donc ..........)

  6. #5
    petitelectron

    Re : qu'est ce qu'une collection d'EST

    Hum... ... donc c'est lors du séquençage que sont produit ces EST ?
    Je ne vois toujours pas l’intérêt... Si on a déjà une banque d'ADNc, à quoi ça sert de faire des EST ?

  7. A voir en vidéo sur Futura
  8. #6
    Moustik34

    Re : qu'est ce qu'une collection d'EST

    Les EST sont utilisés notamment pour localiser de nouveaux gènes dans le génome. A partir d'ARNm, on produit les ADNc. Seules les extrémités 5' et/ou 3' des ADNc sont séquencées. En supposant que le génome soit bien identifié, il suffira d'aligner la séquence avec le génome ou bien d’utiliser la technique FISH afin de déterminer l'emplacement du gène dans l'ADN génomique.

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