qu'est ce qu'une collection d'EST
Bonjour,
Je ne vois pas ce qu'est et à quoi sert un EST ?
Si j'ai bien compris, il s'agit d'un outil de séquençage à partir d'ADNc ... Ceci permet de séquencer les gènes exprimés (?)
Pourquoi parle t on de deux types d'EST (5' et 3'), s'agit il en fait d'amorces ?
Si quelqu'un pourrait m'expliquer le cheminement de cette technique et le but ce serait très sympa.
Merci
Si je ne me trompe pas, la collection d'EST c'est une collection de cDNA (obtenue par RT des ARNm transcrits dans une cellule donnée, dans des conditions donnée).
Jamais entendu l'expression d'EST 5' et 3' désolé.
Cham
Je pense que tu pourras trouver toutes les réponses dans ce site :
http://ead.univ-angers.fr/~jaspard/P.../4EST/1EST.htm
je le trouve complet et assez clair.
en fait c'est très simple : les EST ou express sequence tag sont des petits fragments de séquences exprimées et vu que dans les banques de séquences tu n'as pas d'ARNm mais des ADNc correspondants à ceux-ci, les EST sont tout simplement des petits "morceaux" de ces ADNc ; et en fait les EST5' sont des EST obtenus au niveau de la partie 5' du ADNc et les 3' à partir du 3' de l'adnC, pour info tu retrouveras bcp plus d'EST 3' que 5' car en fait beaucoup d'ARNm qui ont été Rtranscrits en ADNc ont été "capturés" par leur queue polyA (en 3' donc ..........)
Hum... ... donc c'est lors du séquençage que sont produit ces EST ?
Je ne vois toujours pas l’intérêt... Si on a déjà une banque d'ADNc, à quoi ça sert de faire des EST ?
Les EST sont utilisés notamment pour localiser de nouveaux gènes dans le génome. A partir d'ARNm, on produit les ADNc. Seules les extrémités 5' et/ou 3' des ADNc sont séquencées. En supposant que le génome soit bien identifié, il suffira d'aligner la séquence avec le génome ou bien d’utiliser la technique FISH afin de déterminer l'emplacement du gène dans l'ADN génomique.
