Interpréter une courbe de fusion PCR
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Interpréter une courbe de fusion PCR



  1. #1
    inviteb71ae72e

    Interpréter une courbe de fusion PCR


    ------

    Bonjour,

    Je suis en stage et je pratique l'extraction d'ARN, la RT-PCR et la PCR.
    Je fais de la PCR quantitative (Sybr Green) sur le gène de l'actine. Après amplification, je réalise une courbe de fusion. Lors de l'analyse de la courbe (module Tm calling), au lieu du pic habituellement rencontré, j'ai obtenu un plateau.
    Je n'arrive pas à comprendre ce plateau. Sauriez-vous expliquer cette observation?
    Merci de votre attention.

    Panda7

    -----

  2. #2
    Flyingbike
    Modérateur*

    Re : Interpréter une courbe de fusion PCR

    une image nous aiderait certainement !

    pour le plateau, c'est mauvais signe, mais déjà avez vous eu un signal normal en intensité (ie l'amplification a été efficace ?)

  3. #3
    inviteb71ae72e

    Re : Interpréter une courbe de fusion PCR

    Bonjour,

    Voila l'image ci-dessous de la courbe de fusion.
    Nom : IMG_20130123_152403.jpg
Affichages : 1366
Taille : 646,6 Ko

    Merci

    Panda7

  4. #4
    Flyingbike
    Modérateur*

    Re : Interpréter une courbe de fusion PCR

    ca peut etre compliqué. On peut notamment penser a une température d'annealing trop froide, ce qui fait du non spé. Qelles sont vos amorces et votre protocole de PCR ? quels sont les échantillons ?

  5. A voir en vidéo sur Futura

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