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UCSC Genome Browser



  1. #1
    nipuide

    UCSC Genome Browser


    ------

    Bonsoir

    J'ai du mal à comprendre cet outil. http://genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgTracks

    Je veux étudier l'opsine chez l'homme.
    Je connais sa position approximative
    chrX:153230000-153630000

    Je me centre sur le gène OPN1MW.
    Son premier gène voisin de gauche c'est qui?
    C'est TEX28 ou OPN1LW?
    Et son deuxième gène voisin toujours de gauche?


    Merci d'avance.

    -----

  2. Publicité
  3. #2
    mh34

    Re : UCSC Genome Browser

    Bonjour.
    L'image que vous montrez ne correspond pas au chromosome X mais au 21...vous aurez déjà des problèmes pour trouver le gène de l'opsine dessus...vous pouvez essayer de passer par autre chose.
    Genre ça? http://genatlas.medecine.univ-paris5...che.php?n=5350
    Bon courage.

    p.s ; sinon, sur le site d'UCSC, vous avez une aide disponible....http://genome.ucsc.edu/goldenPath/he...racksHelp.html

  4. #3
    mh34

    Re : UCSC Genome Browser

    Oups, désolée, oubliez mon message précédent, c'est moi qui ai buggé en ouvrant votre lien ; c'est bien la bonne localisation sur la page d'UCSC...

  5. #4
    nipuide

    Re : UCSC Genome Browser

    Bonjour

    Justement je ne comprends pas l'aide de l'UCSC.

    Merci pour votre lien
    Si je comprends bien, le premier voisin à gauche c'est OPN1LW, et le second MECP2?

  6. #5
    mh34

    Re : UCSC Genome Browser

    Citation Envoyé par nipuide Voir le message
    Si je comprends bien, le premier voisin à gauche c'est OPN1LW, et le second MECP2?
    C'est aussi ce que je comprends...

  7. A voir en vidéo sur Futura

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