[Biologie Moléculaire] Melt curve qPCR
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Melt curve qPCR



  1. #1
    invite1286ed0b

    Melt curve qPCR


    ------

    Bonjour à tous, j'ai un petit problème sur mes melt curves de qPCR. Je suit 28 gènes + 3 gènes de ref sur une plaque 96 puits et quand je passe mes plaques avec des meltcurves j'ai ce genre de résultats:
    Nom : meltcurve.png
Affichages : 296
Taille : 52,4 Ko
    Comme on peut le voir les courbes sont bien pour tous mes gènes mais le problème c'est le pré-pic à 70°C, il est plus ou moins important selon les gènes. Je n'arrive pas à savoir si il s'agit de dimères d'amorces, d'une contamination ou autre... se qui m'étonne c'est que ces pré-pic sont tous à la même température.
    Si vous pensez qu'il s'agit de dimère, que peut-on faire pour les éviter?

    Merci pour votre réponse
    Quentin

    -----

  2. #2
    invite1286ed0b

    Re : Melt curve qPCR

    Sinon pour vous donner plus d'info les plaques sont pré-coaté avec les amorces puis déshydratés en étuves à 60°C. On peut ainsi conserver les plaques 'prêtes à l'emploi pendant quelques semaines'. Avant d'être déposés sur les plaques, les amorces sont réhydratés dans une solution contenant 2 mM de tréhalose (selon la plublication de Jutta Zagon et al, 2011) afin que les amorces résistent à la déshydratation. Pour les melt curve que je vous montre il s'agit d'ADNcde feuille de tomate.

    Si quelqu'un à une idée.
    Merci et bonne journée

  3. #3
    invitef0362c6c

    Re : Melt curve qPCR

    As-tu essayé de mettre tes échantillons sur gel pour t'assurer d'y voir une seule bande?

  4. #4
    invite1286ed0b

    Re : Melt curve qPCR

    oui tous mes amplicons ont été déposés sur gel après PCR, une seule bande pour tous les gènes...

  5. A voir en vidéo sur Futura

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