bonsoir
svp , par quoi on commence pour étudier un géne de resistance INCONNU à un antibiotique chez une bacterie .je veux savoir les étapes (techniques moléculaires)necessaire : de l'identification de la presense d'une resistance chez cette bacterie jusqu'au la localisation du gène responsable de cette resistance .
merci
SAlut
Question: est-ce que tu es sur que la resistance est bien due à un gène de resistance?
YOyo
oui biensur. par exemple la resistance aux betalactamines est du en faite à la prèsense de gene qui code pour l'enzyme beta-lactamase qui degrade cet antibiotique.Et donc la resistance est due à un géne de resistance .
Bonjour
Le plus simple, le plus rapide et économique est le séquençage de l'ADN génomique bactérien.
Dans mon labo, on fait comme cela :
Culture des bactéries en présence de l'ATB dilué (voir très dilué). On augmente la concentration de l'ATB au fur et à mesure, puis on les cultive sur agar avec la dose standard d'ATB. Il y a généralement plusieurs bactéries/colonies qui ont développé la résistance. On séquence ensuite pour savoir où les mutations se situent (pour en faire des cartes), ce qui permet ensuite d'en déduire les sites les plus fréquents de mutation qui induisent une résistance (ou multi-résistance).
On connait également assez les ATB pour avoir une idée de leur mode d'action juste en regardant leur structure, ce qui permet de réduire/affiner les résultats.
Ton raisonement est simpliste, certains antibiotiques n'agissent qu'en fonction du type de Gram, simplement car la membrane bactérienne n'a pas les meme spécificités. Dans ce cas la il n'y a pas de gene de resistance.Envoyé par asma.gad
YOyo
Sans parler des plasmides... dans ce cas il ne suffit pas de séquencer le chromosome.
