Articles importants dans Nature, Science ou Cell

[invite17a570c1]

Un PNAS très intéressant :


Cognitive control in media multitaskers.
Ophir E, Nass C, Wagner AD. Proc Natl Acad Sci U S A. 2009 Aug 24.


Chronic media multitasking is quickly becoming ubiquitous, although processing multiple incoming streams of information is considered a challenge for human cognition. A series of experiments addressed whether there are systematic differences in information processing styles between chronically heavy and light media multitaskers. A trait media multitasking index was developed to identify groups of heavy and light media multitaskers. These two groups were then compared along established cognitive control dimensions. Results showed that heavy media multitaskers are more susceptible to interference from irrelevant environmental stimuli and from irrelevant representations in memory. This led to the surprising result that heavy media multitaskers performed worse on a test of task-switching ability, likely due to reduced ability to filter out interference from the irrelevant task set. These results demonstrate that media multitasking, a rapidly growing societal trend, is associated with a distinct approach to fundamental information processing.
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[inviteee9cffed]

Salut à tous voici un article qui est sorti aujourd'hui dans Cell.

http://download.cell.com/pdf/PIIS009...ermediate=true

Somatic Sex Reprogramming of Adult
Ovaries to Testes by FOXL2 Ablation

In mammals, the transcription factor SRY, encoded
by the Y chromosome, is normally responsible for
triggering the indifferent gonads to develop as testes
rather than ovaries. However, testis differentiation
can occur in its absence. Here we demonstrate in
the mouse that a single factor, the forkhead transcriptional
regulator FOXL2, is required to prevent
transdifferentiation of an adult ovary to a testis.
Inducible deletion of Foxl2 in adult ovarian follicles
leads to immediate upregulation of testis-specific
genes including the critical SRY target gene Sox9.
Concordantly, reprogramming of granulosa and
theca cell lineages into Sertoli-like and Leydig-like
cell lineages occurs with testosterone levels comparable
to those of normal XY male littermates. Our
results show that maintenance of the ovarian phenotype
is an active process throughout life. They might
also have important medical implications for the
understanding and treatment of some disorders of
sexual development in children and premature
menopause in women.

Pour résumer et vulgariser: chez des souris femelles adultes, cette équipe induit l'invalidation d'un seul gene (Foxl2) connu pour être impliqué dans la formation de l'ovaire durant la vie foetale et cela à pour concéquence d'induire la transdifférenciation des cellules somatiques vers un phénotype mâle.

Pour moi et mes débuts dans la biologie cela me fait percevoir différemment certains concepts: un organe développé et différencié n'est pas invariablement bloqué dans une voie et un destin in vivo chez l'adulte.
La modification de l'expression d'un seul gène chez l'adulte peut intégralement modifier la physiologie d'un organe entier!

c'est Fou

Bonne lecture

[inviteae6c05c4]

Bonjour à tous,

en parcourant cette discussion j'ai été surpris de ne découvrir aucune publi traitant des thérapies géniques ou cellulaires, et comme c'est un domaine qui me tient à coeur, je vous fais profiter du dernier en date.

En plus, c'est un succès d'une équipe française (qui a dit chauvin ? ).

Vous en avez peut-être entendu parler aux infos il n'y a pas si longtemps.

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Science. 2009 Nov 6;326(5954):818-23.

Hematopoietic stem cell gene therapy with a lentiviral vector in X-linked adrenoleukodystrophy.

Cartier N et al.


X-linked adrenoleukodystrophy (ALD) is a severe brain demyelinating disease in boys that is caused by a deficiency in ALD protein, an adenosine triphosphate-binding cassette transporter encoded by the ABCD1 gene. ALD progression can be halted by allogeneic hematopoietic cell transplantation (HCT). We initiated a gene therapy trial in two ALD patients for whom there were no matched donors. Autologous CD34+ cells were removed from the patients, genetically corrected ex vivo with a lentiviral vector encoding wild-type ABCD1, and then re-infused into the patients after they had received myeloablative treatment. Over a span of 24 to 30 months of follow-up, we detected polyclonal reconstitution, with 9 to 14% of granulocytes, monocytes, and T and B lymphocytes expressing the ALD protein. These results strongly suggest that hematopoietic stem cells were transduced in the patients. Beginning 14 to 16 months after infusion of the genetically corrected cells, progressive cerebral demyelination in the two patients stopped, a clinical outcome comparable to that achieved by allogeneic HCT. Thus, lentiviral-mediated gene therapy of hematopoietic stem cells can provide clinical benefits in ALD.


Magnifique, non ?

[invitef08e6467]

Et oui plus généralement cela rappelle que de nombreux papiers (si ce n'est tous) contiennent des erreurs ou des raccourcis parfois abusifs. Je ne sais plus où j'avais lu (et qui disait) que 90% des publications sont fausses et que seules 10% sont réellement de nouvelles découvertes.
Ce chiffre parait énorme mais malheureusement beaucoup de résultats sont sur-interprétés.

Évidemment j'arrive toujours trois plombes après la guerre... J'ai lu dans un Mensuel du CNRS qu'une étude à été menée par des informaticiens et infographistes sur les photos des publications d'une grande revue (PNAS il me semble) et sur les publications étudiées, 3 possédaient des photos fortement retouchées (sous entendues modifiées, des bandes rajoutées sur des gels...) ce qui représentait me semble t-il, 6%. Bien sur rien ne garanti que les résultats soient faux.. peut ne s'agit il que d'une tentative d'amélioration d'un résultat pour passer dans une grande revue. J'ai néanmoins trouvé ça extrêmement choquant, moi qui n'hésite pas à refaire 20 fois une PCR pour avoir un beau gel avec une belle migration même pour le marqueur de taille!!!!

[invite30157012]

Fabien, je n'ai pas lu l'article de Science mais Nathalie Cartier est venue nous faire une présentation de ces travaux là ou je bosse, et le thérapie génique, quand ça marche (ce qui était loin d'être gagné), ça a quelque chose de magique je trouve!

[invite71f23525]

Voici un coup de maître : démontrer in vivo que les cellules souches hématopoïétiques émergent de l'aorte au cours de l'embryogenèse.

In vivo imaging of haematopoietic cells emerging from the mouse aortic endothelium.

Boisset JC, van Cappellen W, Andrieu-Soler C, Galjart N, Dzierzak E, Robin C.

[1] Erasmus Medical Center, Department of Cell Biology, [2] Erasmus Medical Center, Erasmus Stem Cell Institute.

Haematopoietic stem cells (HSCs), responsible for blood production in the adult mouse, are first detected in the dorsal aorta starting at embryonic day 10.5 (E10.5). Immunohistological analysis of fixed embryo sections has revealed the presence of haematopoietic cell clusters attached to the aortic endothelium where HSCs might localize. The origin of HSCs has long been controversial and several candidates of the direct HSC precursors have been proposed (for review see ref. 7), including a specialized endothelial cell population with a haemogenic potential. Such cells have been described both in vitro in the embryonic stem cell (ESC) culture system and retrospectively in vivo by endothelial lineage tracing and conditional deletion experiments. Whether the transition from haemogenic endothelium to HSC actually occurs in the mouse embryonic aorta is still unclear and requires direct and real-time in vivo observation. To address this issue we used time-lapse confocal imaging and a new dissection procedure to visualize the deeply located aorta. Here we show the dynamic de novo emergence of phenotypically defined HSCs (Sca1(+), c-kit(+), CD41(+)) directly from ventral aortic haemogenic endothelial cells.

Bravo JC!

Greg

[invitedef6ee4e]

Ca me rappelle furieusement les travaux Philippe Herbomel qui a montré en 1999 la meme chose (avec les macrophages) dans Zebrafish...
Le petit poisson transparent avait 10 ans d'avance et n'a pas eu le droit au "grand" journal

Herbomel, P., Thisse, B., and Thisse, C. (1999) Ontogeny and behaviour of early macrophages in the zebrafish embryo. Development. 126(17):3735-3745

[invite17a570c1]

Je viens de voir ce papier de PNAS (sorti hier) que je trouve très original :

Comparing genomes to computer operating systems in terms of the topology and evolution of their regulatory control networks

Koon-Kiu Yana, Gang Fanga, Nitin Bhardwaja, Roger P. Alexandera, and Mark Gerstein, PNAS 2010

The genome has often been called the operating system (OS) for a living organism. A computer OS is described by a regulatory control network termed the call graph, which is analogous to the transcriptional regulatory network in a cell. To apply our firsthand knowledge of the architecture of software systems to understand cellular design principles, we present a comparison between the transcriptional regulatory network of a well-studied bacterium (Escherichia coli) and the call graph of a canonical OS (Linux) in terms of topology and evolution. We show that both networks have a fundamentally hierarchical layout, but there is a key difference: The transcriptional regulatory network possesses a few global regulators at the top and many targets at the bottom; conversely, the call graph has many regulators controlling a small set of generic functions. This top-heavy organization leads to highly overlapping functional modules in the call graph, in contrast to the relatively independent modules in the regulatory network. We further develop a way to measure evolutionary rates comparably between the two networks and explain this difference in terms of network evolution. The process of biological evolution via random mutation and subsequent selection tightly constrains the evolution of regulatory network hubs. The call graph, however, exhibits rapid evolution of its highly connected generic components, made possible by designers’ continual fine-tuning. These findings stem from the design principles of the two systems: robustness for biological systems and cost effectiveness (reuse) for software systems.

La suite est ici : http://www.pnas.org/content/early/2010/04/28/0914771107

Bonne lecture

[Pfhoryan]

Voilà, une nouvelle étape vient d'être franchie.
J Craig Venter a réussi son coup. Lui et son équipe ont créé la première cellule dont le génôme est entièrement synthétique et qui se réplique!
C'est dans Science: http://www.sciencemag.org/cgi/conten...cience.1190719

[invitec9f0f895]

Merci pour le lien! c'est vrai que ca risque de boulverser pas mal de chose en biologie!

Yoyo

[Pfhoryan]

Je ne sais pas. C'est plus du domaine de la performance technique que du changement de paradigme.

[invitec9f0f895]

Je ne sais pas. C'est plus du domaine de la performance technique que du changement de paradigme.

Je ne suis pas d'accord! derriere la performance technique il y a aussi de nombreuses questions qui se bousculent!
En extrapolant, ca donnerai quoi si on mettait le génome d'un plasmodium dans un E. coli débarassée de son propre génome
?

Yoyo

[gorben]

J'avoue etre un peu d'accord avec Pfhoryan. C'est enormement de travail, un cout probablement colossal mais scientifiquement y'a pas grand chose de nouveau. La transplantation de genome c'etait interessant mais ca a deja ete publie. Pour moi ce papier c'est du clonage, sous clonage etc... puis transplantation. J'avoue que je saisis mal ou se trouve l'interet scientifique de copier un genome et conclure que c'est le meme...

Je ne suis pas d'accord! derriere la performance technique il y a aussi de nombreuses questions qui se bousculent!
En extrapolant, ca donnerai quoi si on mettait le génome d'un plasmodium dans un E. coli débarassée de son propre génome
Yoyo

Plasmodium ?? La si il y arrive, je pense que beaucoup vont l'admirer (moi le premier).
Tu ne voulais pas plutot dire Mycoplasma? Dans l'hypothese ou le genome de Mycoplasma ne soit pas completement detruit par les endonucleases de coli, et dans l'hypothese ou la machinerie celulaire de coli soit suffisante pour initier la "greffe", on aurait pendant quelques generations un hybride Mycoplasma/E. coli puis les proteines de coli se dilueraient pour finir d'exister (plus ou moins rapidement, probablement detruite par les proteases de mycoplasma). On aurait ensuite un mycoplasma tout beau et tout neuf

A+

[invitee863e61a]

J'avoue etre un peu d'accord avec Pfhoryan. C'est enormement de travail, un cout probablement colossal mais scientifiquement y'a pas grand chose de nouveau. La transplantation de genome c'etait interessant mais ca a deja ete publie. Pour moi ce papier c'est du clonage, sous clonage etc... puis transplantation. J'avoue que je saisis mal ou se trouve l'interet scientifique de copier un genome et conclure que c'est le meme...


Plasmodium ?? La si il y arrive, je pense que beaucoup vont l'admirer (moi le premier).
Tu ne voulais pas plutot dire Mycoplasma? Dans l'hypothese ou le genome de Mycoplasma ne soit pas completement detruit par les endonucleases de coli, et dans l'hypothese ou la machinerie celulaire de coli soit suffisante pour initier la "greffe", on aurait pendant quelques generations un hybride Mycoplasma/E. coli puis les proteines de coli se dilueraient pour finir d'exister (plus ou moins rapidement, probablement detruite par les proteases de mycoplasma). On aurait ensuite un mycoplasma tout beau et tout neuf

A+

Ca me fait penser au paradoxe du bateau de Thésée...

[Pfhoryan]

Les structuralistes sont très forts pour associer le fun et le travail. Voici un article dans Nature qui montre que l'on peut transformer des non scientifiques en experts du repliement des protéines

Predicting protein structures with a multiplayer online game

En prime, si on joue à ce jeu, on devient automatiquement coauteur d'un papier dans Nature
A quand la version pour iPhone?

[invite71f23525]

David Baker a eu là une idée de génie! Il y a deux ans j'y avais joué une petite semaine par curiosité. C'est un jeu très bien fait mais qui demande beaucoup de temps et de patience pour arriver à faire quelque chose de "natif". Bon courage aux futurs joueurs!

[invite71f23525]

Alors ça, ça en jette!!

Deciphering the splicing code, Nature 2010

Barash Y, Calarco JA, Gao W, Pan Q, Wang X, Shai O, Blencowe BJ, Frey BJ.

Biomedical Engineering, Department of Electrical and Computer Engineering, University of Toronto, 10 King's College Road, Toronto M5S 3G4, Canada.

Comment in:

* Nature. 2010 May 6;465(7294):45-6.
* Nature. 2010 May 6;465(7294):16-7.

Abstract

Alternative splicing has a crucial role in the generation of biological complexity, and its misregulation is often involved in human disease. Here we describe the assembly of a 'splicing code', which uses combinations of hundreds of RNA features to predict tissue-dependent changes in alternative splicing for thousands of exons. The code determines new classes of splicing patterns, identifies distinct regulatory programs in different tissues, and identifies mutation-verified regulatory sequences. Widespread regulatory strategies are revealed, including the use of unexpectedly large combinations of features, the establishment of low exon inclusion levels that are overcome by features in specific tissues, the appearance of features deeper into introns than previously appreciated, and the modulation of splice variant levels by transcript structure characteristics. The code detected a class of exons whose inclusion silences expression in adult tissues by activating nonsense-mediated messenger RNA decay, but whose exclusion promotes expression during embryogenesis. The code facilitates the discovery and detailed characterization of regulated alternative splicing events on a genome-wide scale.

[Flyingbike]

Un truc balaise qui m'a fait halluciner :
Les auteurs ont modifié un ribosome pour le rendre capable de décoder des codons de 4 nucléotides, permettant ainsi avec une machinerie adaptée (dont les ARNt) de faire incorporer a peu près n'importe quel acide aminé naturel ou totalement artificiel dans une protéine.

Nature. 2010 Mar 18;464(7287):441-4. Epub 2010 Feb 14.
Encoding multiple unnatural amino acids via evolution of a quadruplet-decoding ribosome.
Neumann H, Wang K, Davis L, Garcia-Alai M, Chin JW.

Medical Research Council Laboratory of Molecular Biology, Hills Road, Cambridge CB2 0QH, UK.
Comment in:

Nat Methods. 2010 May;7(5):343.
Chem Biol. 2010 Apr 23;17(4):320-1.
Abstract
The in vivo, genetically programmed incorporation of designer amino acids allows the properties of proteins to be tailored with molecular precision. The Methanococcus jannaschii tyrosyl-transfer-RNA synthetase-tRNA(CUA) (MjTyrRS-tRNA(CUA)) and the Methanosarcina barkeri pyrrolysyl-tRNA synthetase-tRNA(CUA) (MbPylRS-tRNA(CUA)) orthogonal pairs have been evolved to incorporate a range of unnatural amino acids in response to the amber codon in Escherichia coli. However, the potential of synthetic genetic code expansion is generally limited to the low efficiency incorporation of a single type of unnatural amino acid at a time, because every triplet codon in the universal genetic code is used in encoding the synthesis of the proteome. To encode efficiently many distinct unnatural amino acids into proteins we require blank codons and mutually orthogonal aminoacyl-tRNA synthetase-tRNA pairs that recognize unnatural amino acids and decode the new codons. Here we synthetically evolve an orthogonal ribosome (ribo-Q1) that efficiently decodes a series of quadruplet codons and the amber codon, providing several blank codons on an orthogonal messenger RNA, which it specifically translates. By creating mutually orthogonal aminoacyl-tRNA synthetase-tRNA pairs and combining them with ribo-Q1 we direct the incorporation of distinct unnatural amino acids in response to two of the new blank codons on the orthogonal mRNA. Using this code, we genetically direct the formation of a specific, redox-insensitive, nanoscale protein cross-link by the bio-orthogonal cycloaddition of encoded azide- and alkyne-containing amino acids. Because the synthetase-tRNA pairs used have been evolved to incorporate numerous unnatural amino acids, it will be possible to encode more than 200 unnatural amino acid combinations using this approach. As ribo-Q1 independently decodes a series of quadruplet codons, this work provides foundational technologies for the encoded synthesis and synthetic evolution of unnatural polymers in cells.

PMID: 20154731 [PubMed - indexed for MEDLINE]

[Pfhoryan]

Et pour rester sur les ribosomes, la première structure d'un ribosome d'eucaryote dans Science, un vrai graal pour les structuralistes:

Crystal Structure of the Eukaryotic Ribosome
Adam Ben-Shem*, Lasse Jenner, Gulnara Yusupova and Marat Yusupov* (2010) Science 330, p1203.

Crystal structures of prokaryotic ribosomes have described in detail the universally conserved core of the translation mechanism. However, many facets of the translation process in eukaryotes are not shared with prokaryotes. The crystal structure of the yeast 80S ribosome determined at 4.15 angstrom resolution reveals the higher complexity of eukaryotic ribosomes, which are 40% larger than their bacterial counterparts. Our model shows how eukaryote-specific elements considerably expand the network of interactions within the ribosome and provides insights into eukaryote-specific features of protein synthesis. Our crystals capture the ribosome in the ratcheted state, which is essential for translocation of mRNA and transfer RNA (tRNA), and in which the small ribosomal subunit has rotated with respect to the large subunit. We describe the conformational changes in both ribosomal subunits that are involved in ratcheting and their implications in coordination between the two associated subunits and in mRNA and tRNA translocation.


Et cerise sur le gateau, c'est une équipe française (IGBMC à Strasbourg)

Bon, 4.15 Å, c'est pas top, mais ils ont apparemment déjà des données à 3 Å sous la main.

[invitec9f0f895]

Salut

En effet grande avancée... dommage pour eux que le prix Nobel ait deja été donné pour le ribosome!
Sinon dans la meme ordre d'idée, on a obtenu des données de cryoEM a 5,5A pour deux ribosomes eucaryotes. Ce qui est quasiment des résolutions atomiques!

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20980660

YOyo

[invite86aad8f6]

Je suppose que vous en avez tous entendu parler :

A Bacterium That Can Grow by Using Arsenic Instead of Phosphorus
Felisa Wolfe-Simon,1,2* Jodi Switzer Blum,2 Thomas R. Kulp,2 Gwyneth W. Gordon,3 Shelley E. Hoeft,2
Jennifer Pett-Ridge,4 John F. Stolz,5 Samuel M. Webb,6 Peter K. Weber,4 Paul C. W. Davies,1,7 Ariel D.
Anbar,1,3,8 Ronald S. Oremland2

Life is mostly composed of the elements carbon, hydrogen,
nitrogen, oxygen, sulfur and phosphorus. Although these
six elements make up nucleic acids, proteins and lipids
and thus the bulk of living matter, it is theoretically
possible that some other elements in the periodic table
could serve the same functions. Here we describe a
bacterium, strain GFAJ-1 of the Halomonadaceae,
isolated from Mono Lake, CA, which substitutes arsenic
for phosphorus to sustain its growth. Our data show
evidence for arsenate in macromolecules that normally
contain phosphate, most notably nucleic acids and
proteins. Exchange of one of the major bio-elements may
have profound evolutionary and geochemical significance.

enorme quand même...

[Pfhoryan]

enorme quand même...

Elle se fait bien allumer en ce moment, à tel point que Science ce sent obligé de lui porté secours en lui ouvrant une tribune.

Morceau choisi à propos de la pureté de l'ADN analysé:

"One reason that we thought it was pretty consistent is that the DNA fraction that was used for further analyses, including things like PCR, would require highly purified DNA. So any of those contaminants, if indeed they were there, would have been a problem."

Depuis quand faut-il de l'ADN pur pour réussir une PCR? à croire qu'elle ne sait pas de quoi elle parle... C'est mauvais signe.

[invitee170a0e7]

+1.

Je trouve cette histoire un peu trop "médiatisé" / "tappe à l'oeil".
Il n'y a rien de vraiment nouveau, il y a déjà eu des publications dessus (je me souviens avoir vu une passé dans un PNAS)

[invite86aad8f6]

bah bah bah..
Ca reste du super solide, et le travail est novateur. On a jamais vu l'equivalent aussi bien décrit. Après, certe, l'histoire est très médiatisée...

[inviteee9cffed]

Cet article est une révolution!
Depuis 2006 il était convenu que l'AR dans l'ovaire foetal permettait l'initiation de la méiose des cellules germinales alors que son absence dans le testicule fœtal faisait que les cellules germinales ne faisaient pas la méiose avant la vie adulte.

Nat Commun. 2011 Jan;2(1):151.
Sex-specific timing of meiotic initiation is regulated by Cyp26b1 independent of retinoic acid signalling.

Kumar S, Chatzi C, Brade T, Cunningham TJ, Zhao X, Duester G.

Sanford-Burnham Medical Research Institute, Development and Aging Program, 10901 North Torrey Pines Road, La Jolla, California 92037, USA


Sex-specific initiation of meiosis in the fetal ovary has been suggested to require retinoic acid (RA) for induction of Stra8, with expression of the RA-degrading enzyme Cyp26b1 in fetal testis delaying meiosis until postnatal development. In this study, we investigate Raldh2(-/-) mice lacking RA synthesis and signalling in mesonephros and adjacent gonad and reveal that Stra8 expression in the fetal ovary does not require RA signalling. In contrast to previous observations, we find that Stra8 is expressed in the absence of physiologically detectable levels of RA. Ketoconazole inhibition of Cyp26b1 in Raldh2(-/-) testis allows RA-independent induction of Stra8, but only when the mesonephros remains attached, pointing to a non-RA signal from the mesonephros that induces Stra8 in the adjacent gonad. These findings demonstrate that Cyp26b1 prevents the onset of meiosis by metabolizing a substrate other than RA that controls Stra8 expression, thus changing the paradigm for how studies on Cyp26 function are conducted.


PS: si vous voulez l'article il est très dure à avoir alors demandez le moi par MP.

[piwi]

Pour le papier de Duester, on pouvait un peu se douter des conclusions générales.
Stra8 peu s'exprimer sans AR/ l'AR ne contrôle pas l'initiation de la méiose: on sait que dans le testicule, il n'y a pas de RAR dans les spermatogonies préleptotènes et leptotènes. Du coup, on voit mal comment l'AR pourrait directement contrôler l'entrée en méiose et induire l'expression de Stra8.

Sinon, bien joué mantOs; bravo!

[invite3c235e37]

Bonjour,
Le ribosomes est dogmatiquement considéré comme un effecteur neutre de la traduction. Quelques maladies rares ont pour origines des défaut dans la biogenèse des ribosomes (Dyskeratose congénitale lié à l'X, Anémie de Diamond-Blackfan etc...) mais aucune études n'a été en mesure d'affirmer que le ribosome lui même pouvait être un régulateur de la traduction (en tout cas chez les mammifères, chez la levure Komili et al. avaient imaginé un "code ribosome" dans Cell en 2007, mais c'est un cas particulier).
Cet article est le premier à démontrer que le ribosome est non seulement l'effecteur, mais aussi un régulateur de la traduction. Un nouveau champ s'ouvre ici!

Ribosome-Mediated Specificity in Hox mRNA Translation and Vertebrate Tissue Patterning.

Kondrashov, Nadya, Pusic, Aya, Stumpf, Craig R, Shimizu, Kunihiko, Hsieh, Andrew C, Xue, Shifeng, Ishijima, Junko, Shiroishi, Toshihiko, Barna, Maria

Cell (2011) vol. 145 (3) pp. 383-97

DOI 10.1016/j.cell.2011.03.028

Historically, the ribosome has been viewed as a complex ribozyme with constitutive rather than regulatory capacity in mRNA translation. Here we identify mutations of the Ribosomal Protein L38 (Rpl38) gene in mice exhibiting surprising tissue-specific patterning defects, including pronounced homeotic transformations of the axial skeleton. In Rpl38 mutant embryos, global protein synthesis is unchanged; however the translation of a select subset of Homeobox mRNAs is perturbed. Our data reveal that RPL38 facilitates 80S complex formation on these mRNAs as a regulatory component of the ribosome to confer transcript-specific translational control. We further show that Rpl38 expression is markedly enriched in regions of the embryo where loss-of-function phenotypes occur. Unexpectedly, a ribosomal protein (RP) expression screen reveals dynamic regulation of individual RPs within the vertebrate embryo. Collectively, these findings suggest that RP activity may be highly regulated to impart a new layer of specificity in the control of gene expression and mammalian development.

P.S. : À lire aussi, la mini revue de Sonenberg à propos de cet article:
Translational Control by the Eukaryotic Ribosome.
Topisirovic, Ivan, Sonenberg, Nahum
Cell (2011) vol. 145 (3) pp. 333-4

[invite2ac96057]

pour ma part, je choisi une avancée dans la compréhension de la pathologie parasitaire alliant mes deux sujets de prédilection, la parasitologie et la virologie.


Science. 2011 Feb 11;331(6018):775-8.

Leishmania RNA virus controls the severity of mucocutaneous leishmaniasis.

Ives A, Ronet C, Prevel F, Ruzzante G, Fuertes-Marraco S, Schutz F, Zangger H, Revaz-Breton M, Lye LF, Hickerson SM, Beverley SM, Acha-Orbea H, Launois P, Fasel N, Masina S.

Abstract
Mucocutaneous leishmaniasis is caused by infections with intracellular parasites of the Leishmania Viannia subgenus, including Leishmania guyanensis. The pathology develops after parasite dissemination to nasopharyngeal tissues, where destructive metastatic lesions form with chronic inflammation. Currently, the mechanisms involved in lesion development are poorly understood. Here we show that metastasizing parasites have a high Leishmania RNA virus-1 (LRV1) burden that is recognized by the host Toll-like receptor 3 (TLR3) to induce proinflammatory cytokines and chemokines. Paradoxically, these TLR3-mediated immune responses rendered mice more susceptible to infection, and the animals developed an increased footpad swelling and parasitemia. Thus, LRV1 in the metastasizing parasites subverted the host immune response to Leishmania and promoted parasite persistence.

[invite71f23525]

Pas une publie mais une revue et quelle revue!!! Pour ma part, je n'ai jamais lu une meilleure revue que celle là (c'est purement subjectif car c'est sur le cancer, et c'est un Cell...) :

Hallmarks of cancer: the next generation.
Hanahan D, Weinberg RA.

The hallmarks of cancer comprise six biological capabilities acquired during the multistep development of human tumors. The hallmarks constitute an organizing principle for rationalizing the complexities of neoplastic disease. They include sustaining proliferative signaling, evading growth suppressors, resisting cell death, enabling replicative immortality, inducing angiogenesis, and activating invasion and metastasis. Underlying these hallmarks are genome instability, which generates the genetic diversity that expedites their acquisition, and inflammation, which fosters multiple hallmark functions. Conceptual progress in the last decade has added two emerging hallmarks of potential generality to this list-reprogramming of energy metabolism and evading immune destruction. In addition to cancer cells, tumors exhibit another dimension of complexity: they contain a repertoire of recruited, ostensibly normal cells that contribute to the acquisition of hallmark traits by creating the "tumor microenvironment." Recognition of the widespread applicability of these concepts will increasingly affect the development of new means to treat human cancer.

[invitec9f0f895]

Bonjour

Un article qui est très interessant sur le plan de l'approche méthodologique.
Je n'ai pas acces à la revue en question, il faudra donc vous contenter du communiqué de presse du CNRS

http://www2.cnrs.fr/presse/communique/2240.htm

L'actu a évidemment été reprise par votre site préféré
http://www.futura-sciences.com/fr/ne...49/#xtor=RSS-8

Yoyo