Bonjour,
Je suis en master 1 de bio-informatique, et je suis actuellement en stage à l'INRA de Bordeaux.
Je suis en plein développement d'un outils informatique qui servira à analyser des données (fichiers format fastq obtenues à partir de la banque de données NCBI).
Mon application doit donc pouvoir charger le fichier, le lire les données (séquence nucléotidiques) et faire des chevauchements puis fusionner pour avoir des contig.
Problème: je n'arrive pas à comprendre le mécanisme d'un chevauchement?? Sous quels critères on détecte les séquences où il y a chevauchement???
A l'aide svp!!
MERCI
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