Chevauchement des ORF

[invite153e7487]

Salut!

Ma question va peut etre paraitre un peu bete, mais a-t-on deja trouve un exemple chez les bacteries de deux genes codant l'un en cis et l'autre en trans et dont les deux cadres de lectures se chevauchent?

Il me semble que cela a ete montre chez les eucaryotes mais je n'en suis pas sur et n'ai aucun exemple concret... Si cela existe bien, savez-vous quels sont les liens entre ces deux genes, et quelle est la regulation empechant les polymerases de se rentrer dedans (ou peut etre est-ce justement ca, la regulation? )

Merci a bientot!

PS: apres lecture d'autres posts, c'est peut etre pas ORF dans le titre, mais CDS
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[invitee863e61a]

- Qu'entends tu par cis et trans? l'une sur un brin, l'autre sur l'autre brin? Dans ce cas, oui cela existe, mais c'est plus courant chez les virus.
- Il a été montré (et même observé en microscopie électronique!) des collisions d'ARN polymérase entre promoteurs convergents (qui se font face). J'ai même trouvé récemment une petite animation réglable:

http://cmol.nbi.dk/models/dna/rnap.html

Il semble que ce genre d'organisation de gène permettent parfois des régulations, l'activité d'un promoteur affectant celle de l'autre.

[invite153e7487]

Cool !
T'as des references pour les virus?

[Yoyo]

salut

si tu parles d'orfs chevauchantes tu parles au niveau traductionnel? ou au niveau des genes (transcription).
Dans le premier cas, cela s'appelle des frameshift (ou decalage du cadre de lecture). On en trouve chez les virus, les procaryotes, et les eucaryotes.
ca permet notamment d'exprimer deux protéines différentes a partir du meme ARNm

Yoyo

[A voir en vidéo sur Futura]

[invite17a570c1]

Ouaip, cas marrant chez les IS

Cordialement,

[invite32ebe868]

Il y'en a chez Arabidopsis.
Cela permet de réguler de manière négative via un long siRNA la défense de la plante.
Le premier gène va être induit par une infection, son expression va permettre l'expression du siRNA qui va permettre la dégradation de l'autre gène impliqué dans la défense des plantes (en fait, ce gène bloque l'expression de la défense des plantes d'où sa dégradation va favoriser la défense)
C le seul exemple concret que je connais.

[LXR]

Salut,

chez l'homme, les gènes de P14Arf et P16INK4A se chevauchent. C'est à dire que le promoteur de P14 est en amont du promoteur de P16, et en plus un épissage alternatif va se faire au niveau d'exons communs aux pré-ARNm des deux gènes. Certaines parties sont donc communes aux deux gènes, et pour la petite histoire, ce sont tous les deux des suppresseurs de tumeurs. Donc certaines mutations peuvent affecter les deux gènes à la fois. C'est l'un des points faibles de notre génome en matière de protection contre la transformation tumorale.
A part ça, je pense qu'une petite recherche sur des bases de données comme "Entrez Gene" ou "Ensembl" peuvent te donner la cartographie de ces deux gènes, la preuve en image est toujours mieux.

Greg

[invite153e7487]

Merci a vous!
si vous avez d'autres exemples, n'hesitez pas