Bonjour à toutes à et à tous,
Je suis en pleines révisions et je bloque sur quelques petites choses à propos des PCR, RT-PCR et RT-qPCR.
J'ai bien compris que lors d'une RT-qPCR, on utilise une poly-dT par exemple pour faire la RT afin de transformer nos ARNm en ADNc (on doit travailler sur un pool d'ARNm [gène cible et gène de référence] donc on ne peut pas utiliser d'amorce spécifique. Et c'est donc après la RT qu'on design des amorces spécifiques de nos différents gènes.
Là où je bloque c'est à propos de la RT-PCR simplement.
A l'un de nos TPs de bioinformatique nous avions du designer des primers pour la RT-PCR.
Je pense avoir compris pourquoi on utilise des amorces à cheval sur 2 exons : pour sélectionner les ARNm épissés et non les ARN primaires.
Mais est-ce que les amorces utilisées pour la RT sont les mêmes que celles utilisées pour la PCR qui suit de l'ADNc ?
Pour l'élaboration de primers pour la RT-PCR, suffit-il "simplement" de designer un couple d'amorces sens et anti-sens simplement en en dessinant à cheval sur des exons et que ca fonctionne et pour la RT et pour la PCR ?
Merci d'avance,
Mystral
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