Biologie des systèmes

[MrEpinard]

Bonjour,

Je ne comprends pas trop en quoi consiste cette discipline et quelle sont ces applications en recherche médicale (pas trop d’informations sur le net). En quoi diffère-t-elle de la bioinformatique ?

Merci en avance
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[Geb]

Bonjour,

Je préfère le dire d'emblée, je ne suis pas spécialiste, loin de là, je ne suis même pas scientifique. Cela dit, je viens de passer quelques dizaines de minutes sur Google scholar pour essayer de te fournir une réponse quelque peu argumentée et sourcée.

À ma connaissance, il s'agit d'une jeune discipline (elle a un peu plus de vingt ans) qui après une courte recherche, semble avoir séduit les spécialistes d'anatomie en premier lieu (Markwald, 1998 ; Pollard, 2000).

J'ai trouvé une définition plus ou moins intelligible ici : A New Approach to Decoding Life: Systems Biology (Ideker et al., 2001)

Systems biology studies biological systems by systematically perturbing them (biologically, genetically, or chemically); monitoring the gene, protein, and informational pathway responses; integrating these data; and ultimately, formulating mathematical models that describe the structure of the system and its response to individual perturbations.

Ce qu'on pourrait traduire approximativement par : « La biologie des systèmes étudie les systèmes biologiques en les perturbant systématiquement (perturbations biologiques, génétiques ou chimiques), en examinant les réponses des gènes, des protéines et des voies d'information ; en intégrant ces données ; et finalement, en formulant des modèles mathématiques capables de décrire la structure du système et de prédire sa réponse aux perturbations individuelles. »

Donc, je dirais que la biologie des systèmes est un champ de recherche faisant appel à plusieurs disciplines et qu'il fait notamment un usage important de la bioinformatique (particulièrement lors des deux dernières étapes : intégration et modélisation), sans pour autant n'être que de la bioinformatique.

Dès 2001, Hiroaki Kitano a été en charge de l'édition d'un livre au demeurant assez complet sur le sujet : Foundations of Systems Biology

Il a également écrit quelques articles assez pédagogiques, dans les prestigieuses revues Science et Nature, sur cette nouvelle discipline :

- Systems Biology: A Brief Overview (Kitano, 2002)
- Computational systems biology (Kitano, 2002)

Cordialement.