Relation DO/Comptages cellulaires

[fourchetteetcouteau]

Bonjour,

j'ai suivi une culture d'algues par DO et comptages sur cellules de Malassez. Je dois établir une relation DO/comptages. On m'a dit de mettre les comptages en log et de faire un graphe avec en abscisse la DO et en ordonnée l'abondance celllulaire. Je dois avoir une régression linéaire de type 2 passant par 0 normalement.

Je sais que c'est une fonction de type "abondance cellulaire = a x DO + b" mais concrètement je ne sais pas comment procéder pour l'obtenir sur mon logiciel excel...

Je dois par la suite déterminer ma biomasse maximale avec la "DO transformée en abondance cellulaire"...


Sur excel j'ai tracé un graphe (nuage de points) avec la DO en abscisse et mes abondances (cells/mL) loguées (log) en ordonnées et j'ai mis une "courbe de tendance linéaire", l'équation de la droite est y = 2,0595x + 6,2766. S'il y a "+6,2766" cela veut dire que ça ne passe pas par zéro... Je suis un peu perdue...

Merci d'avance
-----

[fourchetteetcouteau]

Jour Comptage (Y) DO (X)
3 3,54E+06 0,028100001
5 2,19E+06 0,057166668
6 2,73E+06 0,056099998
7 1,75E+06 0,103533333
10 2,75E+06 0,095300004
11 3,44E+06 0,116833334
12 3,13E+06 0,127066667
13 3,01E+06 0,13
14 3,55E+06 0,142500003
17 5,84E+06 0,191166664
18 5,72E+06 0,266299998
19 1,11E+07 0,310066675
20 8,02E+06 0,301666662
21 9,60E+06 0,355766659
24 1,11E+07 0,379599993
25 1,16E+07 0,382300004
26 1,16E+07 0,410500005
27 1,35E+07 0,401399995
28 1,57E+07 0,44403333
31 1,96E+07 0,454900001
32 2,32E+07 0,435466662
33 2,14E+07 0,497499997
34 1,77E+07 0,522533312
38 1,91E+07 0,537133351
40 2,65E+07 0,561166659
42 2,47E+07 0,541233336

Voilà une de mes croissances, j'ai testé plein de choses mais je ne vois pas comment procéder.

Merci

[Flyingbike]

il y a un souci avec vos données je pense. Si on extrapole vers DO ->0, on est très très loin d'être à zéro comptage.

Vous êtes sure des données ?

[fourchetteetcouteau]

Merci pour votre réponse,

mes données ont été moyennées à partir de triplicats qui avaient un écart-type parfois grand. Je pense que cela peut jouer la dessus. En plus les mesures ont été réalisées tous les jours et non pas à partir d'une dilution sérielle, j'ai eu parfois du mal à faire les comptages sur cellule de Malassez car les cellules formaient des agrégats. J'ai effectué mes comptages en comptant au moins 100 cellules, 3 fois par culture.

[A voir en vidéo sur Futura]

[Flyingbike]

la modélisation linéaire n'est pas mal, mais en principe la concentration est proportionnelle à la densité optique, au moins dans une certaine fourchette.

Ce qui est embêtant c'est que vous êtes très très loin de passer par zéro....

[fourchetteetcouteau]

Oui, concrètement cela veut dire que même à une Do de 0 y aurait des cellules... pourtant j'ai retiré la DO du milieu de culture dans mes données pour n'avoir que la DO des cellules.

[Flyingbike]

a quelle longueur d'onde avez vous lu ?

[fourchetteetcouteau]

J'ai lu à 680nm, pour les milieux de culture seuls et les cultures avec algues.

[Flyingbike]

en 3 jours, vous parvenez à 10E6, mais en 42 jours vous n'avez gagné qu'un log ?

Je ne suis pas familier avec les algues mais il y a un truc qui m'échappe....


Vous partez avec quel inoculum ?

[fourchetteetcouteau]

à J0 (juste après avoir inoculé) la DO à 680 nm (avec la DO du milieu soustrait) était à 0,245. Je pensais que la croissance (les 4 phases) prendrait environ 15 jours mais les algues ont mis environ 10 jours avant de commencer à pousser, le dernier repiquage datait d'un mois, elles étaient peut être pas très en forme.