Visualisation molécule

[loris]

Bonjour à vous tous et bonne année =)

Dans le cadre de mon T.P.E. sur les moyen de communication des fourmis, j'aurais besoins de visualiser les molécules qui composent les phéromones.
J'ai déjà essayé Rasmol et Rastop mais le problème c'est qu'avant de pouvoir visualiser les molécules il faut les importer or comme il s'agit de formules compliqués, impossible de les trouver sur le net.
Je voudrais savoir s'il n'existerai pas un logiciel où l'on peut rentrer la formule chimique puis qui affiche la molécule.

Merci de votre aide
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[invite6a1fa462]

Bonjour. J'ai fait un TPE similaire en terminale(qui d'ailleurs n'a pas été une réussite...), nous nous étions servis de modèles moléculaires pour visualiser les structures 3D des phéromones des fourmis. C'est un peu long à construire mais pas compliqué du tout! Je pense que c'est le plus simple. Demande à tes profs, ils en ont surement qui trainent au fond du labo!

[invite1662a2d9]

Un logiciel classique est Chemdraw et ce serait effectivement etonnant que tes profs ne l'aient pas installé qqpart...

[invitec921af68]

Que cherches-tu exactement ?

[A voir en vidéo sur Futura]

[loris]

Bonjour. J'ai fait un TPE similaire en terminale(qui d'ailleurs n'a pas été une réussite...), nous nous étions servis de modèles moléculaires pour visualiser les structures 3D des phéromones des fourmis. C'est un peu long à construire mais pas compliqué du tout! Je pense que c'est le plus simple. Demande à tes profs, ils en ont surement qui trainent au fond du labo!

Le problème avec ce système c'est qu'il faut savoir la géométrie de la molècules, ce que je recherche à savoir grâce a un logiciel

Un logiciel classique est Chemdraw et ce serait effectivement etonnant que tes profs ne l'aient pas installé qqpart...

J'ai aussi essayé avec Chemdraw, mais la aussi il faut (enfin je n'est réussi qu'à ça) donc je n'avance pas plus qu'avec rasmol

Que cherches-tu exactement ?

Enfaite je voudrais déjà intégrer une animation de la molécule a mon dossier puis ensuite mettre en évidence des fonctions qui composent ces molécules.

[loris]

personne??

[HarleyApril]

si tu as rasmol, donne moi le nom de tes molécules et je t'en fais passer un fichier utilisable dans rasmol

[loris]

A si ça te dérange pas ça m'aiderait beaucoup ^^
Alors: C6H12O - C8H16O et C8H12N2.

Merci

[inviteb836950d]

A si ça te dérange pas ça m'aiderait beaucoup ^^
Alors: C6H12O - C8H16O et C8H12N2.

Merci

Sais-tu ce que sont des isomères ??

[loris]

euh... na ^^

[invitec921af68]

Il faut que tu donnes le nom des molécules, ou leur formule développée, avec stéréochimie s'il y a lieu.

[loris]

Les noms des molécules ça je les ai, les formules développée je pense aussi les avoir trouvées, par contre la stéréochimie c'est bien la forme de la molécule dan sl'espace non? Si c'est sa, c'est que je recherche déja sur papier puis par visualisation 3d.

[invite7ed8e144]

Oui, il faut que tu recherche sur papier, surtout qu'en biochimie (et donc avec les phéromones) la stéréochimie est cruciale. En fait il n'existe pas de logiciel qui te donnera LA forme 3D de la molécule à partir de la formule simple ou même semi-développée. Au mieux tu pourra obtenir une liste de possibilités de structures stables (et encore je connais pas de logiciel qui le fasse)

Donc le mieux c'est de chercher dans une banque de données de structures, si tu as le nom savant de la molécule.

[loris]

Ok ok, donc oui j'ai les noms savant des molécules, connais-tu une banque de données de structures?

[invitec921af68]

Si tu nous les donnais, le nom de tes molécules...

[loris]

IL s'agit de l'octan-3one et l'hexan-3one

[invitec921af68]

J'ai tes deux fichiers .pdb

[inviteba87d5d7]

Voila un de tes molécules. Tu as pleins de proprietés et tu peux la telecharger pour la visualisé en 3D. Bonne soirée.
http://www.chemspider.com/Chemical-Structure.11025.html
En cherchant sur le site tu trouvera octan-2one et octan-4one mais je n'ai pas trouvé le -3one.