Chimie organique: logiciel pour visualisation de molécules en 3D
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Chimie organique: logiciel pour visualisation de molécules en 3D



  1. #1
    bleubxl

    Red face Chimie organique: logiciel pour visualisation de molécules en 3D


    ------

    Bonsoir,

    Je viens de commencer un cours de chimie organique. Ma prof m'a conseillé d'acheter des modèles 3D pour mieux se représenter les molécules organiques complexes. Je me demandais si il existait un logiciel (genre géogebra) sauf pour la chimie qui permet de représenter des molécules en 3D? Connaisssez vous de bons programmes ? Je trouve que ce serait plus pratique et ça ne prend pas de place.

    Merci d'avance,

    -----
    Memento audere semper

  2. #2
    HarleyApril
    Modérateur

    Re : Chimie organique: logiciel pour visualisation de molécules en 3D

    bonsoir

    je crains que tu ne trouves rien de gratuit ...
    chem3D avec chemDraw est pas mal

    si tu peux racheter un logiciel appelé Alchemy (même une vieille version) il est très convivial

    cordialement

  3. #3
    ZuIIchI

    Re : Chimie organique: logiciel pour visualisation de molécules en 3D

    Si en gratuit il y a chemsketch. Il n'est pas bon quand tu crées des molécules compliquées mais ça devrait largement faire l'affaire pour ton niveau.

  4. #4
    HarleyApril
    Modérateur

    Re : Chimie organique: logiciel pour visualisation de molécules en 3D

    Chemsketch fait du 3D ?
    il faut un petit minimiseur pour avoir des angles de liaisons à peu près normaux, sinon il va nous dessiner des cyclohexanes plans

  5. A voir en vidéo sur Futura
  6. #5
    ZuIIchI

    Re : Chimie organique: logiciel pour visualisation de molécules en 3D

    Oui c'est le logiciel que j'utilisais en licence pour les schema pour mes rapports et ce que j'ai constaté c'est qu'il considère mal les interactions stériques. Le cas qui m'a choqué était la complexation d'un Zn par une petite tetraamine cyclique. Les chaines carbonées du ligands se rentraient presque dedans.

    Mais sinon pour les cyclohexanes, même substitués, et d'autres molécules assez sophistiquées, il n'y a pas de problème de représentation. Il faut juste veiller à faire une minimisation énergétique après avoir dessiné la structure et passer en 3D. J'ai l'impression qu'il respecte la VSEPR quand il n'y a pas de motif particulier.

  7. #6
    whoami

    Re : Chimie organique: logiciel pour visualisation de molécules en 3D

    Bonjour,

    Un peu de pâte à modeler + quelques allumettes.

    Et c'est bien plus formateur qu'un logiciel, concernant la vision dans l'espace.

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