Bonjour,
j'ai quelques soucis et incompréhensions avec le calcul du pHi d'un tripeptide, ou d'un peptide..
Si je prends comme exemple :
Ser-Glu-Arg
avec pKac pKan et pKar
Ser 3,6 9,5
Glu 3,5 9,4 3,2
Arg 3,9 9,8 12
Je trouve comme fonctions ionisables : le COOH du Glu, le NH2+ de l'Arg , L'amine N-terminale de la Ser, et L'acide carboxylique de l'arg
Lorsque je trace mon échelle de pH de 0 à 14 je trouve donc :
0 14
/----------------------------------------------------------/
-3,2 3,9 9,5 12
Maintenant mon soucis est de savoir entre quels pKa je vais pouvoir trouver le pHi
- Est ce que à pH=0 le tripeptide a toujours une charge globale positive ? (je suppose que pH=0 donc il va forcément être inférieur au pHi donc --> charge globale positive) est ce correct ?
- Je ne sais pas si la Serine aura son Amine N-terminale sous la forme NH3+ ou NH2 au pH=0 ? Comment savoir ?
- Dans ce cas quel est son pHi ici ?
Merci d'avance pour vos réponses.
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