Quelles techniques pour avoir la configuration absolue?

[ecolami]

Bonjour,
Je vois souvent des molécules naturelle avec des formules trés compliquée et de nombreux carbone asymétriques.
Comment, par quels moyens peut-on déterminer leur configuration absolue?
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[moco]

Bonjour,
Il faut d'abord repérer tous les carbones asymétriques ou chiraux. Puis déterminer l'ordre d'importance des substituants de chacun de ces carbones. Et déterminer enfin si chaque carbone est R ou S.

[vpharmaco]

Peut-être qu'Ecolami souhaitait savoir comment on le détermine expérimentalement ??

Si oui, idéalement par diffraction des rayons x (si il y a suffisamment de matière et si le produit cristallise). Sinon, par RMN (notamment via des expériences NOESY, qui permettent d'avoir accès à des infos sur la proximité spatiale des atomes). Une autre façon, potentiellement lourde à mettre en oeuvre++, est la synthèse totale de la molécule (où l'on contrôle les configurations des centres asymétriques) puis la comparaison des propriétés spectro du produit de synthèse par rapport à celles du produit naturel.

Il y a parfois des erreurs dans la détermination de la structure de certains composés naturels qui ne sont corrigées que x mois-années plus tard.

[ecolami]

Bonjour,
J'ai posé la question parce que souvent certaines molécules naturelles sont extraordinairement complexes.
Il me semble alors impossible d'employer des méthodes chimiques pour établir les configurations de chaque centre asymétrique.

[A voir en vidéo sur Futura]

[Kemiste]

Bonjour.

Comme indiqué plus haut, on n'utilise pas de méthode chimique mais des méthodes spectroscopiques ou la DRX pour déterminer les configurations des molécules.

[ecolami]

bonjour,
Question subsidiaire il semble que l'on puisse savoir en biologie sur quels RECEPTEURS s'est fixé un médicaments ou localiser sur une enzyme le site actif.
Je ne sais pas comment c'est possible. Emploie-t-on les même méthodes que pour trouver les configurations absolues? Comme il s'agit de molécules présentes dans des milieux vivant ce n'est ,sans doute, pas possible.

[Kemiste]

Il est possible de cristalliser les protéines et de faire une DRX afin de connaître sa structure 3D. On peut également cristalliser la protéine avec son ligand (ce n'est pas simple...). On peut également faire de la RMN 2D pour connaitre les interactions, par exemple, entre les azotes de la protéine et les protons du ligand. On peut ainsi déterminer quels acides aminés sont impliqués dans le site de reconnaissance.

[HarleyApril]

bonjour,
Question subsidiaire il semble que l'on puisse savoir en biologie sur quels RECEPTEURS s'est fixé un médicaments ou localiser sur une enzyme le site actif.
Je ne sais pas comment c'est possible. Emploie-t-on les même méthodes que pour trouver les configurations absolues? Comme il s'agit de molécules présentes dans des milieux vivant ce n'est ,sans doute, pas possible.

Bonjour ecolami

Comme il s'agit de molécules issues du vivant, on s'appuie parfois sur les voies biosynthétiques ou sur des produits de la même famille pour faire des hypothèses sur les configurations absolues.

Cordialement

[ecolami]

MERCI pour ces informations qui satisfont ma curiosité!