Que pensez-vous du mode de dépistage suivant ?

[bobbyjohnson]

Supposons que l'on veuille dépister par PCR 10 000 personnes.

Disons qu'on estime qu'1% de ces 10 000 personnes sont contaminées, on souhaite savoir lesquelles. On réalise un prélèvement sur chacune des 10 000 personnes. On répartit les prélèvements en 1000 groupes de 10 prélèvements. Pour chaque groupe, on mélange un peu de chacun des 10 prélèvements du groupe et on teste cet échantillon-mélange. On a donc 1000 tests à effectuer. Vu qu'1% des gens sont contaminés, il va y avoir en moyenne 100 échantillons-mélange qui seront testés positifs.

Pour savoir exactement qui est contaminé, on reteste, cette fois-ci individuellement, chacune des 1000 personnes correspondant aux 100 échantillons-mélange précédemment testés positifs.

En théorie, à supposer que mélanger les prélèvement ne change pas la sensibilité du test, on a donc testé 10 000 personnes avec 2000 tests.
-----

[minushabens]

c'est une méthode qui est effectivement employée. On peut même utiliser 2 niveaux de regroupement. Mais effectivement si on mélange trop d'échantillons on perd en sensibilité, donc il faut faire une étude pilote pour déterminer les bons paramètres de la méthode.

[Flyingbike]

je crois qu'en routine, cela est fait pour les dépistages des dons du sang. Pour des raisons économiques et d'optimisation, j'imagine.

Pour les dépistages en PCR, je ne sais pas si c'est effectivement utilisé. Comme le disait minushabens, on perd en sensibilité proportionnellement au nombre d'échantillons poolés. La pertinence de cette méthode est donc à déterminer au cas par cas, selon la prévalence de ce qui est recherché, la sensibilité spécifique du test, et les critères économiques.

Dans le cas de la PCR, je doute qu'on puisse en tirer un avantage, étant données les capacités en termes de nombre de tests possibles en parallèle.

[Antoane]

Bonjour,

C'est ce que proposent les auteurs de cette tribune : https://www.lemonde.fr/idees/article...5124_3232.html mais ils semblent davantage spécialistes en théorie des jeux qu'en biologie.

[A voir en vidéo sur Futura]