[R] Anova, problème d'interpretation

[petitelectron]

Bonjour,

Je suis débutante en statistiques et en langage de programmation. Je souhaitais voir l'influence de différents facteurs agronomiques sur la présence d'un champignon dans une culture. J'ai donc fais sous R une ANCOVA : après avoir fait une régression linéaire multivariée, je souhaite pouvoir additionner les coefficients de chacunes de ces variables. Lorsque je fais le summary de ma régression linéaire (appelons la res.lm) soit summary(res.lm) :

le résultat que j'obtiens me donne l'intercept (je ne sais pas ce que signifie réellement l'intercept, j'ai cru comprendre que c'était le premier point par rapport à l'origine mais je ne vois pas vraiment ce que ça signifie), puis j'ai les résultats pour les différentes variables de ma régression . Le problème est que je n'ai pas toutes les modalités pour chaque variable :

Coefficients:
                                       Estimate Std. Error t value Pr(>|t|)    
(Intercept)                           -5.037811   0.470745 -10.702  < 2e-16 ***
PrécédentClasse 2 (risque modéré)      0.666295   0.429581   1.551  0.12297    
PrécédentClasse 3 (risque élevé)       1.625639   0.774259   2.100  0.03742 *  
PrécédentClasse 4 (risque très élevé)  1.428841   0.302544   4.723 5.25e-06 ***
WsolSEMIS DIRECT                       1.591007   0.642596   2.476  0.01439 *  
WsolTCS                                0.773452   0.284668   2.717  0.00735 ** 
SensibilitéVClasse 2                  -0.078399   0.385679  -0.203  0.83919    
SensibilitéVClasse 3                  -0.440350   0.312829  -1.408  0.16128    
LABOMYCSA                              0.839812   0.435438   1.929  0.05564 .  
TraitementOUI                         -0.016168   0.267702  -0.060  0.95192    
sPluieFlo                              0.001490   0.006447   0.231  0.81757

par exemple pour ma variable appelée "Wsol" j'ai le résultat de "SEMIS DIRECT", le résultat de "TCS", mais normalement je devrais avoir une autre modalité (qui s'appelle "LABOUR") qui n’apparaît pas ... Comment faire pour l'obtenir ?

Je suppose que ça a un lien avec l'intercept mais vu que je ne sais pas à quoi lui même il correspond ....

Merci par avance pour votre aide
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[toothpick-charlie]

R choisit le premier niveau de chaque facteur par ordre alphabétique comme niveau de référence auquel seront comparés les autres niveaux. L'intercept correspond à la moyenne de la réponse quand chaque facteur est à son niveau de référence (et les variables quantitatives à zéro, d'où l'intérêt de centrer les variables quantitatives avant toute chose)

[petitelectron]

ah mince... Et y a t il un moyen "d'extraire" la modalité LABOUR et d'obtenir son coefficient ?
(le but étant d'additionner les coefficients des modalités selon différentes combinaisons de modalités, donc il me les faut toutes ! )

[toothpick-charlie]

tu devrais d'abord te renseigner sur ce que c'est qu'un modèle linéaire, parce que si tu pars comme ça à l'aventure tu vas faire des bêtises.

L'intercept correspond à la modélité LABOUR (c'est ce que je croyais avoir expliqué). Pour la modalité SEMIS DIRECT tu fais la somme -5.037811 + 1.591007 , etc (mais attention, tout cela n'a de sens qu'en l'absence d'interactions).

[A voir en vidéo sur Futura]

[petitelectron]

mais il y a justement des interactions !

[toothpick-charlie]

dans ton modèle je ne vois pas de terme d'interaction.

[petitelectron]

Elles y sont dans ma régression que j'ai retiré au fur et à mesure pour ajuster le modèle mais dans la réalité ces interactions sont bien présentes