RMN : hohaha et noesy

[invite8f0c515e]

Bonjour, j'aurais une question rapide pour un pro de la RMN des protéines :
En tocsy/hohaha on a dans le fingerprint les corrélations HN/Ha au sein de chaque résidu.
En noesy, le couplage dépend de la distance euclidienne et non plus de la distance au travers des liaisons. Dans le fingerprint on aura donc aussi les corrélations Ha[i]/HN[i+1].

Ce que je ne comprends pas, c'est pourquoi certaines tâches bien visibles dans le fingerprint hohaha ne le sont presque plus c'est dans le fingerprint Noesy. Cela voudrait dire que distance HN/Ha > distance Ha[i]/HN[i+1], ce qui pour moi n'est pas forcément vrai... Y'a t'il d'autres paramètres qui déterminent l'intensité de l'effet Overhauser?

Bien cordialement,
Renaud
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[invite21dfc132]

Bonjour,

Je ne suis pas spécialiste en structure, mais juste une question : dans un feuillet beta, n'y aurait-il pas la possibilité que le NH et le CH alpha, qui sont en anti par rapport à la liaison CN soient plus éloignés l'un de l'autre que le NH et le CH alpha voisin (en syn par rapport à la chaine prinicipale) ? C'est une vraie question, je n'ai pas de bio RMNiste sous la main là maintenant tout de suite pour confirmer ou infirmer...

Sinon, du point de vue de la physique, la mobilité peut influer le NOE (puisque c'est un effet lié à la relaxation), donc tu peux chercher de ce côté là...

Bon courage, cordialement,

Hibou