La cellule transcende la chimie, c'est à dire permet de réaliser des réaction contre le gradient chimique essentiellement grâce à l'ATP. Et cet ATP est produit par un mécanisme quasiment unique : les pompes à protons. L'idée est de faire naître un gradient de proton de part et d'autre d'une membrane. Puis d'utiliser ce potentiel pour faire des liaison phosphate. Le point intéressant est que ce mécanisme est sans doute très très précoce. Dans le scénario de Russel, on a un milieu alcalin tiède et riche en hydrogène/méthane séparé de l'océan primotif froid et acide, chargé en CO2 par une membrane poreuse. Ce gradient chimique primitif serait à l'origine du métabolisme primordial.
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