Supprimer somme ligne et colonne = 0 sous condition (LOGICIEL R)

[invite25f0fe25]

Bonjour,

Avec le logiciel R je souhaiterais écrire dans mon script deux commandes :
- la première retire toutes les colonnes ne contenant que des 0
- la seconde retire toutes les lignes ne contenant que des 0

J'avais écrit ceci mais ça ne fonctionne pas bien :

#Création D'un objet comprenant le cumul de toute les unites d'echantillonnage
cum<-apply(tab,2,sum) # 2 designe les colonnes.
cum #cumul des colonnes du tableau = total par espèce
f0<-sum(cum==0) #f0 représente le nombre d'espèces pour lesquelles aucun individu n'a été relevé durant tous les échantillonnages.
#Supprimer les colonnes avec que des 0
for(i in 1:ncol (tab)){
if(cum==0){ #si le nombre d'espèce où aucun individu n'a été trouvé n'est pas nul
tab<-tab[,-i] #alors je veux enlever dans mon tableau les colonnes (espèces) où le recensement total = 0
}else
{tab<-tab[,] #sinon je n'enlève rien
}
}
#Pour visualiser le nouveau nombre de colonnes
nbcolonnes<-ncol(tab)
nbcolonnes

Et pour les lignes :




#Supprimer les lignes avec que des 0 (NE FONCTIONNE PAS apres cum)
cum2<-apply(tab,1,sum)#1 désigne les lignes
cum2
for(l in 1:nrow (tab)){
if(cum2==0){ #si le nombre de relevés pour lesquels aucun individu n'a été référencé n'est pas nul.
tab<-tab[-l,] #alors je veux enlever dans mon tableau les lignes (relevés) où le recensement total (toutes les espèces) du relevé = 0
}else
{tab<-tab[,] #sinon je n'enlève rien
}
}


#Visualiser le nouveau nombre de lignes
nblignes<-nrow(tab)
nblignes


Avez vous des solutions svp ?

Merci d'avance !
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[invite9dc7b526]

bonjour, en supposant que ta matrice A contient des nombres, apply(A,1,min) renvoie un vecteur qui a le même nombre d'éléments que A a de lignes et qui contient le minimum par ligne. De même apply(A,1,max) renvoie les maxima par ligne.

Donc

A[(apply(A,1,min)!=0)|(apply(A,1 ,max)!=0),]

élimine les lignes ne contenant que des zéros. S'il y a des données manquantes il faut ajouter l'option na.rm=T (et décider si on veut garder ou pas les lignes n'ayant que des zéros et des données manquantes)