Info : la peste noire originaire du Kirghizistan

[philippedelimoges]

Bonjour à tous,

Des chercheurs ont pu remonter à la source de la célèbre épidémie médiévale : https://leblob.fr/actualites/origine...fin-identifiee

Cordialement
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[trebor]

Bonjour à tous,

Des chercheurs ont pu remonter à la source de la célèbre épidémie médiévale : https://leblob.fr/actualites/origine...fin-identifiee

Cordialement

Bonjour,
Je lis :
C’est grâce à de l’ADN humain ancien, extrait depuis un site funéraire du 14e siècle.
De l'ADN vieux de 676 ans

[cherallier]

Bonjour,
Je lis :
C’est grâce à de l’ADN humain ancien, extrait depuis un site funéraire du 14e siècle.
De l'ADN vieux de 676 ans

Bonsoir,
Oui, pas de problème, s'il est bien conservé et 600 ans c'est une broutille. Il y a bien quelques chercheurs qui veulent croiser de l'ADN de mammouth avec des éléphants ou au moins faire porter un embryon de mammouth reconstitué à une éléphante, cela veut dire qu'ils ont de l'ADN ! Les Egyptologues étudient les momies et leur ADN pour savoir qui est fils de qui (ou fille) dans les pharaons... La liste est longue des récupération d'ADN.

[Flyingbike]

Il y a bien quelques chercheurs qui veulent croiser de l'ADN de mammouth avec des éléphants ou au moins faire porter un embryon de mammouth reconstitué à une éléphante, cela veut dire qu'ils ont de l'ADN !

Non, eux, ce sont juste des illuminés qui racontent des belles histoires de SF pour soutirer du fric à des investisseurs crédules. Même Jurassic Park est plus convaincant.

Dans le cas qui nous intéresse, effectivement, 676 ans c'est jouable (je n'irais pas jusqu'a "broutille", quand même )

[A voir en vidéo sur Futura]

[cherallier]

Non, eux, ce sont juste des illuminés qui racontent des belles histoires de SF pour soutirer du fric à des investisseurs crédules. Même Jurassic Park est plus convaincant.

Dans le cas qui nous intéresse, effectivement, 676 ans c'est jouable (je n'irais pas jusqu'a "broutille", quand même )

Les généticiens ont pu établir que nous avions un certain pourcentage (j'ai cru lire environ 5%) de l'ADN de Néandertal cela veut bien dire qu'ils ont pu extraire cet ADN néandertalien et le lire (au moins partiellement) pour faire un comparatif avec le notre. C'est vrai que plus on avance dans les temps reculés plus c'est compliqué de trouver de l'ADN exploitable et de l'interpréter quand je disais une broutille c'est vrai que 600 ans n'est vraiment pas un réel obstacle à côté des 40 ou 50 000 ans de Néandertal.
Bonne soirée

[JPL]

Même quand l’ADN ancien est très fragmenté l’informatique fait des merveilles pour recoller les bouts et réparer des corruptions locales, à condition d’avoir beaucoup de fragments.

[MissJenny]

C’est grâce à de l’ADN humain ancien, extrait depuis un site funéraire du 14e siècle.
De l'ADN vieux de 676 ans

pas l'ADN humain, celui de la bactérie Yersinia pestis, agent de la peste. Je ne vois pas comment on peut dire que c'est le lieu d'origine de la peste. A mon avis on peut juste dire qu'elle est passée par là. Ils ont séquencé une souche ancienne, c'est normal qu'elle apparaisse comme "ancestrale" dans les phylogénies, mais ça ne prouve rien, à mon humble avis.

[trebor]

pas l'ADN humain, celui de la bactérie Yersinia pestis, agent de la peste. Je ne vois pas comment on peut dire que c'est le lieu d'origine de la peste. A mon avis on peut juste dire qu'elle est passée par là. Ils ont séquencé une souche ancienne, c'est normal qu'elle apparaisse comme "ancestrale" dans les phylogénies, mais ça ne prouve rien, à mon humble avis.

Oui, mais dans la pulpe des dents.

[MissJenny]

En général c'est plutôt dans la plaque dentaire qu'on cherche des traces de bactéries. J'avais vu un exposé sur le microbiome de la plaque dentaire de momies péruviennes (plus ou moins du même âge qu'ici).

[Deedee81]

Salut,

Même quand l’ADN ancien est très fragmenté l’informatique fait des merveilles pour recoller les bouts et réparer des corruptions locales, à condition d’avoir beaucoup de fragments.

Oui et d'ailleurs :
- il ne faut pas confondre ADN conservé intact et fragmenté. Sur de très longues périodes on n'a que des morceaux, comme Néandertal. Et si on peut en tirer beaucoup d'informations il devient même impossible de tout reconstituer. Avec les Mammouths par exemple (ou Néandertal), il ne faut pas (encore ?) rêver : on n'arrive pas à tout reconstituer. Donc cloner.... non, impossible en l'état actuel, bien qu'on ait de l'ADN de Mammouth (en ch'tits morceaux).
- Même le séquençage de l'ADN moderne se fait par découpe : en morceaux qu'on séquence puis qu'on aboute. Mais là, évidemment, l'ADN complet ne pose pas de soucis : c'est de lui qu'on part Mais il n'empêche que même là reconstituer l'ADN peut être difficile. Voir l'actu récente que j'ai posté : https://forums.futura-sciences.com/a...n-complet.html

De même il ne faut pas confondre "origine de la peste" et "origine d'une épidémie de peste". Intéressant l'actu ici, et trouver l'origine des grandes épidémies de peste du Moyen-Age je trouve ça formidable (même si cela demande encore confirmation et discussion je suppose, même si cela semble solide d'après ce que j'ai lu dans l'actu). Quand on dit "la roue en Europe a pour origine son usage à tel époque dans tel pays", cela ne veut pas nécessairement dire que c'est là que la roue a été inventée. Tout comme lorsqu'on dit "les chiffres Arabes", bien sûr qu'ils viennent de là mais eux-mêmes les avaient obtenus de l'Inde. Ce n'est pas un scoop.

Mais origine proprement dite de la peste, non, bien sûr. J'avais lu que l'on trouve pour de nombreux virus et bactéries les traces dans l'ADN préhistorique !!!! Il y a longtemps que l'on vit avec (presque) les mêmes maladies infectieuses (il y a évidemment eut co-évolution et donc changements des génomes plus ou moins important, sans compter les maladies émergentes. Tout n'est pas aussi ancien).

[MissJenny]

Pour étudier le microbiome on procède en général comme suit :

1) on extrait l'ADN total de l'échantillon (de plaque dentaire ou de pulpe). Dans la plaque dentaire il y a de l'ADN de l'hôte (humain), des animaux et plantes qu'il a ingérés, et éventuellement des bactéries qui vivent dans la cavité orale (ou peut-être dans les animaux qu'il a boulotés)

2) on amplifie un segment d'un gène bactérien, le plus souvent le gène dit "16S". De cette façon on élimine tout ce qui n'est pas bactérie (mais si le segment est trop court, la PCR peut accrocher un bout du 18S de l'hôte, ça nous est arrivé)

3) on séquence "en vrac" ces séquences de 16S (par une technologie appelée "NGS")

4) on "blaste" les séquences pour déterminer les espèces, ou parfois seulement les genres, de bactéries. C'est un travail de bio-informatique, qui commence à être bien balisé.

[JPL]

La plaque dentaire, c’est bien pour le microbiome buccal, mais pour une infection ponctuelle et plus ou moins foudroyante ce n’est pas adapté. La pulpe dentaire est un bien meilleur choix s’agissant d’une bactérie qui utilise le sang comme vecteur d’infection.

[Deedee81]

Question peut-être bête : la pulpe dentaire, on en retrouve dans les fossiles ?

[MissJenny]

La plaque dentaire, c’est bien pour le microbiome buccal, mais pour une infection ponctuelle et plus ou moins foudroyante ce n’est pas adapté. La pulpe dentaire est un bien meilleur choix s’agissant d’une bactérie qui utilise le sang comme vecteur d’infection.

tu as sans-doute raison.

pour deedee ce qui est certain c'est qu'on trouve de l'ADN dans des dents fossiles, mais je pense que c'est surtout dans la dentine.

[Deedee81]

pour deedee ce qui est certain c'est qu'on trouve de l'ADN dans des dents fossiles, mais je pense que c'est surtout dans la dentine.

D'accord, merci

[philippedelimoges]

Bonjour à tous,

Heu ... Le site le Blob vient de republier aujourd'hui un article sur ce sujet (l'ancien lien étant désactivé) ... je ne peux pas vous dire la raison (une coquille dans l'ancienne publication ?) : https://leblob.fr/actualites/peste-n...s-enfin-resolu

Cordialement