ATPsynthétase source d'energie et de surchauffe cerébrale =)

[JOK]

Bonjour,

J'aimerais bien trouver la séquence en acides aminées (ou en nucléotides) de la sous unité C de la partie F0 de l'ATPsynthétase (d'E.coli par exemple), mais je ne sais pas comment m'y prendre.
Je sais que l'asp61 joue un rôle important dans la protonisation intervenant dans le systeme de la proteine, voilà pourquoi je m'interèsse a tout cela....
Je me suis dejà dirigé vers la base de données PBD mais je ne connais pas encore tout ses travers, penser vous que si je trouve la séquence nucléotidique ou en acides aminés de la sous unité C, je pourrais la comparer à la base de données afin de trouver des homologies avec d'autres molécule susceptibles de pouvoir protoniser elles-aussi?
Si vous avez des documents ou des liens internet traitant de la protonisation de l'ATPase communiquez les moi.(j'ai dejà travaillé les travaux effectué par Fillingame)

Je vous remercie d'avance,en vous souhaitant une très bonne fin de week-end.

cordialement JOK
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[Morphine]

Bonsoir,


pour trouver la séquence en acide aminé vas sur:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi
Puis "protein"

Puis dans Search for preotein, tu tapes ce que tu recherches, par exemple:
F0 subunit c E coli

Tu devrais alors trouver la séquence en AA de la sous-unité C de F0 chez E coli.

Pour les comparaisons de séquences, je ne sais pas faire.


Morphine, désolé de cette demi-réponse...

[Morphine]

Re-bonsoir,

je crois me rappeler que tu dois pouvoir faire comme ca:

Une fois que tu as t'as séquence en AA, tu retourne sur le meme site, ici:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/

Tu copie-colle ta séquence ou des fragments de celle-ci, et tu fais "blast".

Puis "format".

C'a devrait te donner les comparaisons de séquences dans les bases de données.
Enfin, j'ai pas d'expérience en la matière, mais je commencerai par là.

Morphine