Conservation d'échantillons biologiques à t° ambiante

[invitea9b6b5a8]

Bonjour,
A votre avis, combien de temps je peux conserver des échantillons biologiques, à température ambiante, en vue d'une extraction d'ADN?
Merci!
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[gorben]

Salut,

Ca depend de ton echantillon. L'ADN est assez resistant par lui meme, tant que les cellules sont vivantes, ton ADN est intact. Par contre tu ne gardes pas aussi longtemps sur la paillasse un morceau de poumon et une culture de bacterie...
Pour ma part, j'ai deja fait des miniprep sur des cultures restees plus d'une semaine sur la paillase. C'est pas l'ideal, mais tu as de l'ADN.

A+

[invitea9b6b5a8]

En fait ce sont des échantillons de queues (de rat) qui ont été congelées à -80°C, je voudrais les (faire)transporter sans utiliser de carboglace (à cause du prix).

[inviteb1765f58]

Au pire transporte tes échantillons dans un sachet étanche recouvert de glace, ce sera toujours mieux que la température ambiante! Comme l'a dit Gorben si c'estpour en extraire de l'ADN ca ne devrait pas poser de soucis, ca ne serait pas le même problème si tu voulais en extraire de l'ARN.

[A voir en vidéo sur Futura]

[invitea9b6b5a8]

D'habitude j'arrive de me débrouiller avec des pains de glaces mis à -80°C pour faire le trajet sans décongeler mes échantillons de plasma (4h de trajet)
En fait là, ca serait pour envoyer les queues aux Etats Unis donc il faut que je compte 48 à 72h.

[inviteb1765f58]

Et que pense tu de tubes rempli d'eau congelés(style tube Falcon de 50 mL) et en entourant ton envoi d'une substance un peu isolante (plastique avec bulles que l'on fait eclater quand on est petit). C'est sûr que ca va allourdir ton colis mais je pense que ca limiterait les dégâts...
L'ideal serait de t'assurer que l'ADN de tes échantillons soit extrait avant leur envoi, il est courant d'envoyer de l'ADN non réfrigéré pour séquencage et celui-ci résiste très bien pendant le transport.

[invitea9b6b5a8]

Merci pour toutes ces petites idées, mais je veux juste savoir si mes échantillons peuvent être décongelés pendant 72h sans trop d'altération de l'ADN.
L'ADN étant très résistant, je (et d'autres personnes de mon labo) suppose que oui mais je préférerais avoir confirmation pour ne pas perdre mes échantillons (et donc du temps).
Merci

[invite98839ab8]

Sincèrement si c'est seulement pour de l'extraction d'ADN je ne pense pas qu'il y ai de problème. L'ADN est très résistant et pour preuve des test ADN effectué sur les cadavre sont possible... Faut pas t inquiéter pour tes échantillons ^^

[gorben]

Salut,

Perso je n'enverai pas des queues de rat comme ca ! Il est sur a 100% que tes queues arriveront decongelees. Outre l'odeur, parce que 3-5 jours a macerer au chaud bof bof, et sauf si tes queues sont steriles, pense aussi a la contamination par les bacteries/levures/moisissures. Pour les premieres, c'est des cellules procaryotes donc ca peut encore aller. Pour les deux suivante, c'est des eucaryotes. Il y a fort a parier que dans ce milieu optimal, les moisissures se fassent plaisir et qu'au final dans ta prep d'ADN tu ais plus de moisissure que de cellule de rat.

Ensuite l'envois d'echantillon biologique par la poste est interdit, surtout si tu veux aller hors europe. Tu dois passer par un transporteur special, ce qui coute tres cher. A ce niveau la, le prix de la carboglace n'est plus vraiment important

Pour finir, tout depend de ce qu'ils comptent faire de l'ADN recu. Si c'est pour faire des pcr ca devrait aller, si c'est pour du southern c'est peut etre deja plus delicat. Si c'est pour du champ pulse, c'est "suicidaire"

Tout ca pour dire qu'il est plus simple de payer un peu plus cher et d'envoyer les echantillons proprements que de les perdre et de devoir les refaire les renvoyer une seconde fois. La solution la plus simple, la mieux et la moins chere etant de faire l'extraction d'ADN toi meme, et d'envoyer l'ADN par la poste.

A+

[invitea9b6b5a8]

Ok,
Je vais déjà essayer de laisser un échantillon test à température ambiante pour voir ce que ca donne...
Pour l'envoi d'échantillons biologiques (non dangereux) c'est apparement possible (Fedex) et ca reste nettement moins cher qu'avec de la carboglace (volume du colis beaucoup plus petit -prix de la carboglace).
L'ADN va être extrait pour génotyper mes animaux.
Si vraiment ce n'est pas possible, je vais essayer de faire extraire l'ADN en france.
...Faut aussi que je consulte la personne avec qui je collabore aux US pour lui demander son avis...

[invitee8b3f97e]

Salut !

Je rejoins l'avis de ceux qui pensent que ca ne posera pas (trop) de problème. Il ne sert à rien à mon avis de rajouter de la glace dans le colis, celle ci va fondre en quelques heures. J'ai déjà fait l'essai de laisser un bac de polystirène fermé contenant de la carboglace sur la paillasse : moins de 24h après il ne restait plus rien.

Pour ce qui est des éventuelles contamination, un emballége sous vide serait sans doute intéressant. Mais je ne pense pas qu'une contamination en 72h dans un tube fermée soit suffisante pour fausser ton analyse.

Bon courage

[invitea12d5e2e]

Bonjour,

Je viens de lire votre post et une idée m'est venue. Le mieux serait de demander l'avis à une entreprise telle que BioSampling Systems qui est spécialiste dans la gestion d'échantillons biologiques et qui propose des systèmes de stockage!

Voili voilou!

Bonne chance.

Pilou

[piwi]

Mais si c'est pour faire du génotypage, faites le vous même... Vous n'avez pas accès à un thermocycleur?
Sinon, si vous n'avez pas accès à la PCR faites au moins l'extraction en PK avant d'envoyer.

Cordialement,
piwi

[invitea12d5e2e]

Oula, ça devient compliqué!