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Séquences consensus



  1. #1
    topullinu

    Séquences consensus

    comment trouver la sequence consensus à partir de :
    met-asp-val-phe-trp-ala....//....glu-met-cys-trp-asp
    voilà je sais qu'en se servant du code genetique on trouve les sequence d'ADN:
    mais je ne sais pas ou du moins je ne suis pas sure, que cela suffit.
    quelqu'un peut il m'aider??
    merci

    -----


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  3. #2
    Yoyo

    Re : squences consensus

    Bonjour

    Une sequence consensus correspond a un motif qui est retrouvé dans plusieurs protéines et qui a a priori la meme fonction.
    Donc pour identifier une sequence consensus, il te faut :
    Soit plusieurs sequences d'une meme proteine (ou d'une meme famille de proteines) que tu aligneras entre elles, afin de determiner la sequence consensus et l'existance d'eventuels motifs.
    Soit il te faut connaitre apriori la sequence du motif que tu cherches, et regarder si il existe ou non dans ta proteine.

    Maintenant ton message parle de l'ADN, et je me demande si il n'y aurait pas confusion,
    Si tu cherches a obtenir la sequence d'ADN a partir d'une proteine,
    alors il te faut la table de conversion codon -> acide amines.
    TU sauras par expl que :
    met = ATG
    Asp= GAT ou GAC
    Val= GTC GTA GTT ou GTG
    ce qui te donne comme sequence d'ADN possible:
    ATGGAYGTN etc...
    on appele cela une sequence dégénérée (car pour certaines positions il existe plusieurs bases possibles qui donneront exactement la meme proteine).
    Yoyo

  4. #3
    topullinu

    Re : squences consensus

    bonjour,
    je te remercie de ta reponse.
    en faite c'est ta seconde reponse qui m'interesse.
    voilà quand j ai trouver la sequence en me servant du code génétique j avais d'abord l'ARN
    j ai donc remplacer le U par le T pour obtenir l'ADN
    et la je ne savais pas si a ce moment là il fallait faire le brin complementaire et ce servir de celui ci pour remplacer les lettres comme tu l as fais.
    donc je me complique un peu la vie, la sequence d'adn suffit simplement.
    merci de ta reponse je suis sure maintenant.
    ps: j ai fais des progres en genetique et reussi toute seule à faire mes exo sur les tetrades.

    merci encore
    et j espere a bientot sur icq
    bonne journée.

  5. #4
    9herve

    Re : squences consensus

    Chapeau bas Yoyo, j'avais pas compris la question! et ne voulais pas me risquer sur le terrain des "séquences consensus" et de leurs exploitations!

  6. #5
    Hermyone

    Re : squences consensus

    Salut tout le monde!!!
    Je n'arrive pas à comprendre qu'est ce que c'est un site consensus d'épissage!!! SVP répondez moi le plus vite possible...Merci d'avance!!!

  7. A voir en vidéo sur Futura
  8. #6
    Yoyo

    Re : squences consensus

    salut

    Quand tu compares tous les sites d'épissage connu, tu peux en deduire une séquence générale les englobants tous.

    ensuite si ton site rentre dans le concensus defini ci-dessus, alors ton site est dit consensus.

    YOyo

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