Séquençage 454

[invitea74316c7]

Bonjour a tous!
Je souhaiterai savoir si l'un de vous pourrait m'apporter des renseignements sur le fonctionnement du séquençage 454 développé par roche car il est impossible d'avoir des détails sur le net!
merci d'avance!
-----

[invite17a570c1]

Salut,
si je me souviens bien de la conférence avec le représentant de Roche, c'est un truc de fou furieux et il n'y a que le Génopole qui en possède pour l'instant à cause du coût super excessif (genre, 10 000€ d'entretien/semaine).

Sinon, voici quelques caractéristiques générales :

* Read lengths averaging 200 to 300 bases per read
* Throughput of more than 400,000 reads per run
* High single-read accuracy of greater than 99.5% over 200 bases
* Consensus-read accuracy of greater than 99.99%

Tu peux trouver tout le principe ici (tu cliques sur le lien "technology" du premier paragraphe) : https://www.roche-applied-science.co...gs20/index.jsp

Cordialement,

[invitef413a247]

Bonjour

Ca depend de ce que tu recherches exactement, mais le 454 est basé sur la méthode de pyroséquençage, tu devrais trouver un peu plus de chose avec ce mot clé (http://www.454.com/). Apres je ne sais pas si le produit dont tu parles est strictement le même, mais le principe est similaire je suppose.

J'ai eu la chance de le voir en action au cours d'un stage dans l'Oklahoma, effectivement ca va très très vite et c'est précis. Un des seuls défauts cependant, ormis le coût (5000$ le run...), c'est lorsqu'il y a répétition d'un même nucléotide : c'est assez difficile de savoir si il y a une répétition de 5 ou 6 fois le même.

Voili voilou Bon courage!