Etude de la topologie des protéines membranaires

[invitec9f0f895]

Bonjour

Je cherche des informations sur comment déterminer la topologie d'une protéine membranaire.

En résumé, j'ai un gene avec un ou deux segments transmembranaires de prédit via différents logiciels. J'aimerai maintenant valider ces predictions...

A vos plumes

Merci
YOyo

[gorben]

Salut,

J'avais fait ca avec le systeme phoA (pQuantagen(xk) vector (Qbiogen, Illkirch, France). Il suffit de faire des proteines de fusion avec phoA, de les exprimer et de suivre la couleur de la bacterie (peut etre que ca marche aussi chez la levure) en presence d'un reactif colore. L'activite de phoA change selon qu'il se trouve cote cytoplasmique (non actif), ou periplasmique (actif)

A+

[invitec9f0f895]

Merci Gorben pour ta reponse, en effet come tu l'as deviné c'est effectivement pour une proteine de levure que je pose la question, j'avais oublié de préciser cela.

Il me semblait qu'on pouvait aussi insérer un site de glycosylation, si ce site se trouve dans le RE alors il sera glycosylé, s'il ne l'est pas il ne le sera pas. ca permettrait de determiner la topologie non?

Autre question, la protéine qui m'interesse est une protéine de la membrane de la vacuole. A votre avis, elle passe par le golgi ou pas?

YOyo