[Biochimie] acides aminés
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acides aminés



  1. #1
    invite5c3f4ec1

    acides aminés


    ------

    bonjour,j aurai besoin d aide dans un exercice

    on etudie 3 heptapeptides opioides=
    H2N-TYR-ALA-PHE-GLY-TYR-PRO-SER-CONH2
    H2N-TYR-MET-PHE-HIS-LEU-MET-ASP-CONH2
    H2N-TYR-ALA-PHE-ASP-VAL-VAL-GLY-GLY-CONH2
    on me demande de calculer pour chaque fonction et pour chaque peptide,la charge du groupement,a ph6 et a ph 7?
    est ce que quelqu un peut m expliquer la methode svp?

    -----

  2. #2
    invite160a5434

    Re : acides aminés

    Bonjour à toi.

    En fait le calcul est un peu savant, mais facilement accessible.
    En fait tu as pour chaque fonction ionisable, une equation du type
    AH=A- + H+

    De cette equation, tu peux faire un tableau d'avancement te permettant de déterminer le coefficient de dissociation alpha.

    Ensuite à partir d'équation genre pH=-log[H+] ou encore celle de la constante de dissociation, tu vas mettre en relation ces différentes équation pour exprimer le coefficient de dissociation en fonction du pH et du pKa.
    Tu arriveras au final à l'équation qui te permettra de déterminer ton coefficient de dissociation alpha= 1/1+10^pka-pH

    A un pH donné et en fonction du pKa de la chaine latérale de ton acide aminé, tu peux déterminer le coefficient de dissociation.

    ce coefficient de dissociation te donnera en fait un pourcentage de charge en fonction de la déprotonation de ton groupement ou non, si celui est acide ou basique.

    Voila, j'espère avoir eclairer un peu ta lanterne.

    Bonne chance

  3. #3
    Inkald

    Re : acides aminés

    Salut je reviens sur ce post justement car j’en ai aussi besoin ! Lol

    Disons AH -> A- + H+
    Avec Co en concentration initiale

    On a en début de réaction [AH] = Co et [A-]=[H+]=0

    On avance dans la réaction et on aura :
    Pour AH :
    C0(1-alpha)
    Et pour A- et H+ :
    Co(alpha)

    Ça d’accord.
    Ensuite si j’exprime ma constante de dissociation je vais avoir :
    Kd = (A- * H+) / AH = (alpha^2 * Co) / (1-alpha)

    Comment à partir de cette équation de Kd je peux déduire la formule de alpha en fonction du pH et du pKa ?

  4. #4
    Tibosax

    Re : acides aminés

    Citation Envoyé par Inkald Voir le message

    Disons AH -> A- + H+
    Avec Co en concentration initiale

    On a en début de réaction [AH] = Co et [A-]=[H+]=0
    C'est fondamentalement juste, mais inutile ici. Le pH est imposé par d'autres composés de la solution (solution tampon). On considère donc que toutes les réactions acido-basiques qui affectent la protéine ne modifient le pH qu'à la marge - et donc pas du tout, car leur concentration est limitée au regard du tampon. Pas besoin de tableau d'avancement donc, et la relation à trouver devient relativement simple. Encore heureux d'ailleurs, déjà les calculs de pH avec deux espèces acido-basiques se compliquent pas mal par rapport à un seul acide faible, ce serait atroce avec plus d'espèces (je ne suis même pas sûr que ce soit solvable analytiquement tiens)

    En tout cas pour le tout premier message. Concernant ton exercice, il faudrait plus de précisions.
    Dernière modification par Tibosax ; 09/09/2019 à 19h46.

  5. A voir en vidéo sur Futura

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