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Bandes d'ADN non amplifié??



  1. #1
    donkey-shot

    Bandes d'ADN non amplifié??


    ------

    Bonjour
    J'ai effectué une PCR certaines amorces ont été révélées incompatibles chez certaines souches, cependant seul quelques souches montrent après analyse sur gel des amplifiats des bandes correspondant à l'ADN (vérifié par la taille correspondant à celle de l'ADN mis au départ), ma question est pourquoi cette bandes n'apparait pas chez les autres souches
    NB: il ne s'agit pas d'une erreure de manipulation, ces résultats étant confirmés par plusieurs essais
    Je vous remercie d'avance pour vos réponses

    -----

  2. #2
    jmbowie

    Re : Bandes d'ADN non amplifié??

    Citation Envoyé par donkey-shot Voir le message
    Bonjour
    J'ai effectué une PCR certaines amorces ont été révélées incompatibles chez certaines souches, cependant seul quelques souches montrent après analyse sur gel des amplifiats des bandes correspondant à l'ADN (vérifié par la taille correspondant à celle de l'ADN mis au départ), ma question est pourquoi cette bandes n'apparait pas chez les autres souches
    NB: il ne s'agit pas d'une erreure de manipulation, ces résultats étant confirmés par plusieurs essais
    Je vous remercie d'avance pour vos réponses
    La réponse la plus simple est que ces souches n'ont pas le fragment d'ADN que tu essaies d'amplifier. Quelle type de molécule supporte ce fragment (chromosome, plasmide)? Est-ce une PCR colonie ou sur une extraction? Il peut aussi s'agir de la présence d'inhibiteurs de PCR dans les extractions d'ADN des souches qui semblent négatives.
    Blast up your life!

  3. #3
    donkey-shot

    Re : Bandes d'ADN non amplifié??

    Citation Envoyé par jmbowie Voir le message
    La réponse la plus simple est que ces souches n'ont pas le fragment d'ADN que tu essaies d'amplifier. Quelle type de molécule supporte ce fragment (chromosome, plasmide)? Est-ce une PCR colonie ou sur une extraction? Il peut aussi s'agir de la présence d'inhibiteurs de PCR dans les extractions d'ADN des souches qui semblent négatives.
    Merci d'abord pour ta réponse, c'est vrai que l'amorce est incompatible, c'est une possibilité, c'était une RAPD, il s'agit d'ADN total extrait, et le problème c que d'autres souches sont négatives sans monter cette bande d'ADN...

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