Répondre à la discussion
Affichage des résultats 1 à 10 sur 10

La postion des éléments de réponse aux hormones



  1. #1
    salsa2008

    La postion des éléments de réponse aux hormones

    Bonjour,
    est ce que les éléments de réponse aux hormones sont toujours situés en amont du site d'initiation de la transcription ou en aval du site de terminaison?

    -----

    Dernière modification par salsa2008 ; 21/10/2008 à 10h10.

  2. Publicité
  3. #2
    piwi

    Re : La postion des éléments de réponse aux hormones

    Non. Ils peuvent aussi se situer dans la séquence codante et en particulier dans le premier intron qui est souvent régulateur.

    Cordialement,
    piwi
    Je sers la science et c'est ma joie.... Il parait.

  4. #3
    salsa2008

    Re : La position des éléments de réponse aux hormones

    Donc c'est pas facile de savoir la position exacte des HREs dans une séquence d'ADN?

  5. #4
    piwi

    Re : La postion des éléments de réponse aux hormones

    Si la séquence est canonique vous pouvez la retrouver en screenant directement une séquence (notez qu'il faut alors chercher jusque très en amont et en aval). Si elle ne l'est pas tout se complique. Il y a des programmes tels que JASPAR ou TFSEARCH qui peuvent vous y aider. Dans tous les cas la validation passe par des tests tels que l'EMSA.

    Cordialement,
    piwi
    Je sers la science et c'est ma joie.... Il parait.

  6. #5
    salsa2008

    Re : La position des éléments de réponse aux hormones

    ce sont des bases de données?
    j'ai pas compris le terme "canonique".En fait je ne suis pas spécialiste en biologie

  7. A voir en vidéo sur Futura
  8. #6
    piwi

    Re : La postion des éléments de réponse aux hormones

    Le HRE est une séquence d'ADN qui n'est pas nécessairement toujours absolument identique dans tous les gènes cibles. Il peut y avoir de petites variation. En général on connait la séquence la plus efficace pour la fixation du récepteur de l'hormone. Donc on peut éventuellement la chercher directement sur la séquence éditée en fichier texte. Mais si vous avez des variations l'ordinateur ne la trouvera pas et il sera difficile de chercher toutes les variantes possibles.
    Du coup, il existe des programmes qui permettent de trouver ces éléments de réponses dégénérés sur une séquence d'ADN. Ce ne sont pas des bases de données. En revanche il vont tout vous sortir sans chercher à comprendre la relevance biologique de la chose. Il faut vérifier si ça veut dire quelque chose biologiquement parlant.
    Je sers la science et c'est ma joie.... Il parait.

  9. Publicité
  10. #7
    salsa2008

    Re : La postion des éléments de réponse aux hormones

    En fait moi je cherche à prédire les HREs et j'essaie d'avoir des informations sur ces éléments

  11. #8
    piwi

    Re : La postion des éléments de réponse aux hormones

    Ils sont variables d'une hormone à l'autre. Il faut donc décomposer le problème hormone par hormone même si la démarche reste la même pour toutes.
    Je sers la science et c'est ma joie.... Il parait.

  12. #9
    salsa2008

    Re : La postion des éléments de réponse aux hormones

    quelles sont les principales caractéristiques des HREs?

  13. #10
    salsa2008

    Re : La postion des éléments de réponse aux hormones

    est ce qu'on peut considerer les HREs comme des short tandem repeats

Sur le même thème :

Discussions similaires

  1. Réponses: 7
    Dernier message: 12/10/2008, 18h21
  2. Réponse aux conspirationnistes du Moon Hoax
    Par Jacques Xing dans le forum Discussions scientifiques
    Réponses: 1
    Dernier message: 11/10/2007, 03h12
  3. Formation liée aux défibrillateurs automatiques (réponse)
    Par marsouin84 dans le forum Secourisme spécial Croix-Rouge
    Réponses: 1
    Dernier message: 28/02/2007, 22h34
  4. Nature des hormones
    Par jess88 dans le forum Biologie
    Réponses: 6
    Dernier message: 29/01/2007, 15h09