[Biologie Moléculaire] bacterie/plasmide
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bacterie/plasmide



  1. #1
    invite58af60a0

    bacterie/plasmide


    ------

    re bonjour,
    j'ai encore une question a laquelle j'ai repondu,seulement je ne suis pas sure de ma reponse!
    je vous met l'énoncé et ma reponse,si quelqu'un peut me dire si je me trompe ou pas svp?
    Alors on dispose de 3ml de culture bacterienne qui represente 3.10^9 bacteries.En admettant qu'on purifie 1 µg d'un plasmide de 3000 paires de bases.on nous donne qu'1 base=310 daltons.il faut calculer le nombre de copies de plasmide contenue dans une bacterie?!
    alors j'ai repondu:

    1 pb=620 Da donc 3000pb=1.86*10^6Da
    or 1Da=1.27*10^-27kg donc 1.86*10^6=3.1*10^-21kg
    de plus,1kg=10^-9µg donc 3.1*10^-21kg=3.1*10^-30µg
    on a purifié 1µg:
    soit 1/3.1*10^-30=3.2*10^29 µg

    on a un échantillon de 3*10^9 bacteries soit:
    3.2*10^29/3*10^9=1*10^20 bacteries
    je sais pas pourquoi ce résultat ne me semble pas tres logique?!
    si quelqu'un peut m'aider,je vous remercie d'avance!

    -----

  2. #2
    piwi

    Re : bacterie/plasmide

    Moi je trouve 216 plasmides/bactérie.
    J'ai fais le calcul directement sur la calculette de mon ordi, je me suis peut être trompé à un moment. Cependant je pense que si je me suis trompé ce serait d'un ordre de grandeur, pas plus. Donc à mon avis c'est soit 22 soit 216. Pas plus.

    Cordialement,
    piwi
    Je sers la science et c'est ma joie.... Il parait.

  3. #3
    gorben

    Re : bacterie/plasmide

    Salut,
    Citation Envoyé par wmnzr Voir le message
    re bonjour,
    j'ai encore une question a laquelle j'ai repondu,seulement je ne suis pas sure de ma reponse!
    je vous met l'énoncé et ma reponse,si quelqu'un peut me dire si je me trompe ou pas svp?
    Alors on dispose de 3ml de culture bacterienne qui represente 3.10^9 bacteries.En admettant qu'on purifie 1 µg d'un plasmide de 3000 paires de bases.on nous donne qu'1 base=310 daltons.il faut calculer le nombre de copies de plasmide contenue dans une bacterie?!
    alors j'ai repondu:

    1 pb=620 Da donc 3000pb=1.86*10^6Da
    or 1Da=1.27*10^-27kg donc 1.86*10^6=3.1*10^-21kg
    de plus,1kg=10^-9µg donc 3.1*10^-21kg=3.1*10^-30µg

    on a purifié 1µg:
    soit 1/3.1*10^-30=3.2*10^29 µg

    on a un échantillon de 3*10^9 bacteries soit:
    3.2*10^29/3*10^9=1*10^20 bacteries
    je sais pas pourquoi ce résultat ne me semble pas tres logique?!
    si quelqu'un peut m'aider,je vous remercie d'avance!
    Non en effet c'est faux. L'erreur est en rouge. Ce sont deux erreurs de calculs tres simple...
    Forcement le reste est faux aussi.

    Selon mes calculs ce n'est pas 22 ni 216 non plus, mais je te dis rien histoire que tu puisses un peu chercher.

    A+
    Dernière modification par gorben ; 03/02/2009 à 03h36.

  4. #4
    piwi

    Re : bacterie/plasmide

    J'ai effectivement fais une erreur un peu sotte. Cela dit je n'ai pas non plus utilisé votre valeur du dalton qui me semble fausse.
    Pour moi le Da = 1/Na avec Na = 6.02.1023 =1.66. 10-24g
    Je sers la science et c'est ma joie.... Il parait.

  5. A voir en vidéo sur Futura
  6. #5
    invite58af60a0

    Re : bacterie/plasmide

    bonjour,
    Tout d'abord merci bcp pour vos réponses!
    J'ai essayé de refaire mes calculs en rouge en corrigeant ma valeur pour le dalton,mais j'arrive quand meme avec un resultat final pour la fraction qui est de 10^11 plasmides/bacterie.
    Je crois que je n'arrive pas a voir mon erreur malgré que j'ai l'impression de passer a coté d'un calcul tout bete et surtout je sais que mon résultat a pas l'air tres logique!

  7. #6
    piwi

    Re : bacterie/plasmide

    Je te dis comment je procède.
    Ton plasmide fait 3000 pb, c'est à dire 6000 b.
    Tu sais qu'un nucléotide fait 310 Da
    La masse M (Da) de ton plasmide est donc 310 x 6000.

    Par ailleurs tu sais qu'un Da = 1.66 10-24g. Donc la masse M (g) = M (Da) x Da

    Comme tu as 1 µg, le nombre N de plasmides est donc 10-6 (g) / M (g)

    Il ne reste plus qu'a le diviser par le nombre de bactéries (3.109) pour avoir N/bactérie


    Il y a une autre approche presque plus instinctive.
    Tu sais que tu as 3.109 bactéries qui contiennent 1 µg de plasmide. Du coup tu peux directement calculer la masse de plasmides par bactérie.
    Il ne te reste plus qu'à transcrire cela en quantité. (1 Da = 1g/mol).
    Comme tu as la masse molaire de ton plasmide, tu transformes ta masse en nombre de moles et tu divises par le nombre d'avogadro (6,02.1023) pour avoir la quantité absolue.

    Cordialement,
    piwi
    Je sers la science et c'est ma joie.... Il parait.

  8. #7
    invite58af60a0

    Re : bacterie/plasmide

    Bonsoir,
    je m'excuse de vous répondre aussi tard,je n'ai pas pu venir avant!Merci bcp pour vos réponse,j'ai enfin pu comprendre ou était mon erreur;en fet j'oubliais tout simplement de multiplier par 10^-6 pour calculer le nombre N de plasmide,c'est pour ca que je trouvais un résultat beaucoup trop grand!
    bonne soirée

  9. #8
    gorben

    Re : bacterie/plasmide

    Ce n'est pas l'erreur qui etait dans ta demonstration du debut, mais si tu trouves le bon resultat c'est nickel...

    A+

  10. #9
    invite58af60a0

    Re : bacterie/plasmide

    non c'est pas l'erreur de ma démonstration,justement apres qu'on m'ai dit que ce que j'avais fait était faux,j'ai refait d'une autre facon mais je trouvais quand meme un résultat pas logique du fait que j'oubliais de multiplier mon nombre de plasmide par 10^-6.Parcontre,ca m'interesserait de savoir qu'est ce qui était faux dans mes deux ligne soulignée en rouge parce que j'arrive tjs pas a voir,c'est pour cela que j'ai procédé d'une autre facon.
    Merci encore en tt cas!

  11. #10
    gorben

    Re : bacterie/plasmide

    Ce sont deux erreurs d'inattention dans les calculs.

    3.1*10^-21kg = 3.1*10^-30µg ?????????

    A+

  12. #11
    invite58af60a0

    Re : bacterie/plasmide

    bonsoir;
    effectivement c'est une erreur tres bete!!je ne sais pas pourquoi je ne l'ai pas vu,j'étais sure que c'etait quelque chose de ce style mais impossible de trouver,c'est pas faute d'avoir refait 30 fois le calcul!!!
    merci en tt cas

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