Polyarginine et structure ordonnee

[invite153fc3fe]

Salut,
Voici la question:Predire si polyarginine est susceptible de former une structure ordonnee à pH=7 et à pH=13.
J'ai trouve le pHi de polyarg.=10.76.
Dans les 2 cas,je dis qu'il y a pas de structure ordonnee car à pH=7,c'est la forme acide et à 13 c'est la forme basique.
Mais la correction de l'exercice n'est pas la meme,ils ont dit qu'à7 il n'y a pas une telle structure et à 13 il y en a.
Et voila je ne comprends pas pourquoi??
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[LXR]

Bonjour,

A pH 7 elle est plutot neutre car la fonction amine est sous forme NH2. A pH 13 elle est basique car NH3+. Etant chargé, elle va pouvoir éventuellement se replier pour qu'une fonction amine chargée de la chaîne latérale vienne interagir de façon électrostatique avec le COOH terminal. Ou encore une molécule d'eau peut servir de ponts entre deux fonctions amines chargées de deux arginines, par interaction électrostatique entre les doublets de l'oxygène de l'eau et le proton de la fonction NH3+, et ainsi provoquer un repliement local, tout dépend de la longueur de la chaîne.

Greg

[invite153fc3fe]

Merci beaucoup pour cette reponse detaillee.