Bonjour à tous,
J'aurais besoin de votre aide
Qu'est-ce que l'approche métagénomique (metagenomic approach en VO) ?
J'ai cru comprendre que c'était une technique pour faire une culture de bactéries qui sont peu cultivables habituellement. On prend ainsi leur "bagage génétique" qu'on implante dans une bactérie e-coli et ensuite on étudie la croissance de cette bactérie.
Mais concrètement ça se fait comment ?
Et avez-vous plus d'infos à me fournir ?
Merci d'avance !
A plus.
Salut
Il n'y a pas de culture stricto-sensus. Tu extrait l'ADN d'une communauté d'organisme totale issue d'un environement donné. Tu clones dans E. coli des morceaux d'ADN aléatoirement dans cette soupe d'ADN. Et tu séquences. Soit aléatoirement, soit tu passes par une étape de criblage des clones (par exemple pour ne séquencer que les clones contenant un inser ADNr)... Il y a des variantes, mais basiquement c'est le principe...
A+
John
Merci John78 pour ces précisions.
Mais je ne suis pas très au courant des techniques d'extraction d'ADN, de séquençage, etc...
Aurais-tu un document ou un site web qui explique bien le tout ? (j'ai trop rien trouvé avec Mr Google)
Houla, je deviens éxigeant
A plus.
Bonjour à tous,
Pareillement, je ne trouve rien sur Google qui soit sufisamment détaillé mais en même temps sufisamment vulgarisé pour que je puisse comprendre.
Si quelqu'un connait un site qui pourrait répondre à ces deux "exigences", je suis aussi preneur.
Michaël.
Salut,
Disons que c'est assez difficile de trouver ce que tu recherches, la métagénomique étant une méthodologie jeune. Regarde ici, peut-être que ça conviendra
Sinon, pose des questions précises, on te répondra
Hope that helps.
Salut à tous,
Merci MaliciaR pour ta réponse. En fait j'étais déjà passé en le survolant sur le lien que tu m'as proposé. Je m'y suis donc replongé plus sérieusement, mais je n'ai pas trouvé ce que je cherchais.
Toute fois je suis tombé sur une présentation dont j'ai tiré un extrait qui shématise et synthétise bien ce que je voulais. Avec quelques recherches parallèles, j'ai pu répondre à le plus part de mes questions.
Quant celles qui me restent, elles ne concernent pas nécéssairement la métagénomique et j'ai notament ouvert une nouvelle discussion sur l'ARNr 16S.
Encore merci de ton aide.
Michaël.
