Carte de restriction

[invitec867c46b]

Bonjour !!

Bon j'ai un "léger" souci avec des cartes de restriction..

On a digéré un phage lambda avec différentes enzymes de restriction, on a fait une électrophorèse.

Maintenant je dois établir la carte de restriction du phage.


Mon marqueur de poids moléculaire est lambda digéré par Hind III. J'obtiens des fragements. J'ai donc regardé les tailles sur Internet.

Ensuite, quand je travaille avec lambda + Eco RI j'obtiens d'autres fragments. Donc j'ai fait des produits en croix du style :
=> si 2,2 cm c'est pour 23130 pb alors 3 cm c'est pour...

Le hic c'est que ça marche pas pk plus je descends, plus j'ai de centimètres et plus mes fragments sont grands...Mais c'est pas logique

Et si je trace log (taille des fragments) = f(distance de migration) j'ai une parabole... (Pour mon marqueur de taille)


Merci BEAUCOUP si qqun pouvait m'aider à démarrer, je suis totalement perdue...
-----

[piwi]

La migration se fait en fonction du log du PM (= taille). Vous ne pouvez pas faire une extrapolation linéaire.
Si vous voulez vous y retrouver faites une représentation distance de migration = f(log PM). Vous aurez alors une droite et vous pourrez trouver la taille de vos fragments beaucoup plus facilement.

Cordialement,
piwi

[invitec867c46b]

Euh...au risque de m'entêter...pk log taille = f(distance) ne peut pas marcher ? J'ai pas trop compris...Si je mets le log, ça devient linéaire non ?

[invitec867c46b]

Personne pour m'aider ? S'il vous plait...C'est un vrai casse-tête cette carte et je n'ai q'un cours sur les protocoles de TP, pas sur l'analyse...

[A voir en vidéo sur Futura]

[invitec9f0f895]

salut

je pense que Piwi t'a répondu, je vois pas bien ce qu'on peut te dire de plus, a part que la zone de linéarité dans un gel est faible et depend de la concentration du gel utilisée.

YOyo