Pourcentage CG

[invite153e7487]

Bonjour !

Pourquoi dans les cartes de chromosomes qu'on peut trouver sur internet (exemple) on indique le pourcentage de répétitions de C et G ?
Je sais que je l'ai su
Merci de me rafraîchir la mémoire!

Bonne journée
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[invite38f0db9e]

Pourquoi dans les cartes de chromosomes qu'on peut trouver sur internet (exemple) on indique le pourcentage de répétitions de C et G ?

Salut !
Parce que les résultats phylogéniques varient selon les données utilisées pour l'analyse, beaucoup de taxinomistes pensent qu'il faut employer toutes les données valables possibles pour établir la phylogénie. Dans cette approche, appelée taxinomie polyphasique, les systèmes taxinomiques sont établis en utilisant une large gamme d'info phénotypiques et génotypiques. Par exemple, on peut utiliser l'analyse en % en GC pour étudier l'espèces et les genres. Alors que pour déterminer les souches, et uniquement les souches, on utilisera les techniques sérologiques.

[invite9e91a17c]

le pourcentage CG indiqué sur cette carte semble presque illisible ... C vrai qu'il est difficile de comprendre son intéret même en systèmatique .. vu que dans le cas présent le modèle est clairement identifier ... est ce que ça n'aurait pas un rapport avec les manipulations en labo vu que le taux de CG influence la température d'hybridation optimale des 2 brins d'ADN (role en PCR ...)

[invite38f0db9e]

est ce que ça n'aurait pas un rapport avec les manipulations en labo vu que le taux de CG influence la température d'hybridation optimale des 2 brins d'ADN (role en PCR ...)

Tout a fait probable, voire même plus pertinent que ma réponse précédente ! Il faudrait en effet une température plus élevée pour briser l'hybridation d'une double hélice riche en GC.

[A voir en vidéo sur Futura]

[invite9e6bc039]

le pourcentage CG indiqué sur cette carte semble presque illisible ... C vrai qu'il est difficile de comprendre son intéret même en systèmatique .. vu que dans le cas présent le modèle est clairement identifier ... est ce que ça n'aurait pas un rapport avec les manipulations en labo vu que le taux de CG influence la température d'hybridation optimale des 2 brins d'ADN (role en PCR ...)

Dans le mille

Cloner une séquence riche en GC est un cauchemar pour les chercheurs, la PCR fonctionne très mal (pour plusieurs raisons mais c'est HS)

[invite153e7487]

la PCR fonctionne très mal (pour plusieurs raisons mais c'est HS)

Nayeki, quelles sont ces raisons?

Merci à tous pour vos réponses et bonne journée!