Cytométrie en flux et significance statistique

[inviteb737c7a9]

Bonjour,

Je débute mon projet de master et vais utiliser un cytomètre en flux.

J'ai une question concernant la significance des résultats. Imaginons que l'on sache qu'un type de cellule X est rare parmi une autre population Y. Si je définis x:y le ratio entre ces populations, j'aimerais savoir combien je dois faire passer de cellules dans mon cytomètre pour que le nombre x obtenus de cellulles soit significatif dans un intervalle de confiance de 95%. Je sais pas si je suis clair..

Disons que je sais qu'une cellule est rare par exemple à hauteur de 0.002%, quel nombre de cellules je dois analyser en tout pour que les résultats obtenus soient significatifs? Avez-vous une formule et/ou un raisonnement qui va avec?

Merci d'avance!
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[sansplomb]

Bonjour,

A 0.002% il vous faut acquérir 20 millions de cellules ou 400 évènements positifs pour avoir un intervalle de 95%.
c`est 100 divisé par la racine carrée de N (la population d`intérêt)
Pour les matheux c`est une loi de poisson.
On observe vite la limitation de la technique dans la recherche d`évènements rares. Pour votre cas 20 millions de cellules c`est énorme (surtout si c`est un tissu) et a 10000 évènements par seconde c`est 30 min d`acquisition par tube.
En plus il vous faudra faire face a d`autres problèmes spécifiques de la cytométrie comme le marquage non spécifique des Ac.


Cordialement

[inviteb737c7a9]

Merci beaucoup pour les infos! Je résume pour les pas doués (comme moi) s'ils tombent sur cette page:

5% de précision = 100 / sqrt(N) d'où

N=(100/5)^2 = 400.

Et comme la population qu'on recherche représente 0.002% du total:

(400 / 0.00002) = 20 000 000.

Je sentais que c'était relativement irréaliste...

[invitee8fd836b]

salut

moi aussi je travaille avec la cytométrie en flux pour mon master.
et comme je n'ai pas trop le temps, jai fais des manip. sur le FACS mais je n'ai pas très bien compris le principe!! ce qui fait, j'ai pris un protocol que j'ai suivi à la lettre, j'ai eu des résultats, je sais vaguement comment les interpréter. (c'était pour la detection d'un récepteur)
Bref! est ce que vous pouvez m'expliquer le principe de manière simple?
parce que j'ai une recherche, mais j'ai pas trop aimé!
merci

[A voir en vidéo sur Futura]