[Génétique] Terme scientifique pour comparaison des séquences d'ADN
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Terme scientifique pour comparaison des séquences d'ADN



  1. #1
    invite25217b75

    Exclamation Terme scientifique pour comparaison des séquences d'ADN


    ------

    Bonsoir,
    Je suis en train de préparer un exposé et je suis tombé sur une question à laquelle je n'ai pas trouvé de réponse, à savoir : comment s'appelle le fait de comparer des séquences d'ADN ?
    Le séquençage serai le fait de séquencer un génome, donc c'est pas ça.
    L'alignement est un procédé qui permet de comparer des séquences, donc c'est pas ça (?).
    Donc, quel est le terme scientifique permettant de définir l'action de comparer des séquence d'ADN ? Avec plusieurs mots clef, je n'ai trouvé nul part un site ou une vidéo ou un magasine donnant un terme spécifique.

    Voici mon sujet :
    Au bout du génome !
    Que signifie séquencer le génome ? Est-ce suffisant pour identifier les gènes et leur fonction ? Comment s'appelle le fait de comparer des séquences d'ADN ? Citer quelques difficultés rencontrées pour résoudre ce problème.

    (Voici un site qui vous permettra de vous rafraichir la mémoire http://interstices.info/jcms/c_10593...-et-proteiques (attention il y a 4 pages) / Vous pouvez en retrouver une partie si vous êtes abonné à "les dossiers de la recherche" N°37 Novembre 2009)

    Je rappelle donc ma question :
    Comment s'appelle le fait de comparer des séquences d'ADN ?
    Y a t-il un terme spécial ? Est ce que "l'alignement" en serai le terme ?

    Je vous remercie par avance.

    -----

  2. #2
    piwi

    Re : Terme scientifique pour comparaison des séquences d'ADN

    Je ne vous comprends pas.

    Vous posez cette question:
    Comment s'appelle le fait de comparer des séquences d'ADN ?
    Puis plus loin dans le texte vous dites...
    L'alignement [de séquences] est un procédé qui permet de comparer des séquences
    ...pour vous empresser de dire que cela n'est pas ce que vous cherchez.

    En quoi ce procédé, qui répond parfaitement aux termes que vous posiez dans votre question, ne correspond il pas à vos attentes? Qu'est ce qui ne vous convient pas?

    Cordialement,
    piwi
    Je sers la science et c'est ma joie.... Il parait.

  3. #3
    invite25217b75

    Re : Terme scientifique pour comparaison des séquences d'ADN

    J'entends par là que "l'alignement" est un procédé qui permet la comparaison. Or je cherche le terme scientifique qu'on utilise pour parler de comparaison de séquences d'ADN.

    Pour prendre un exemple :
    Comment s'appelle le fait de décomposer un corps à l'aide d'un liquide ?
    réponse : une dissolution.

  4. #4
    invite25217b75

    Re : Terme scientifique pour comparaison des séquences d'ADN

    A lire et relire mon exemple, j'ai l'impression que vous avez raison.
    La dissolution est aussi un procédé permettant de décomposer un coprs à l'aide de liquide.
    Donc vraissensablement, "l'alignement des séquences" est le terme recherché.

    J'atttends cependant d'éventuelles remarques de personnes avertis sur le sujet

  5. A voir en vidéo sur Futura
  6. #5
    piwi

    Re : Terme scientifique pour comparaison des séquences d'ADN

    Et bien on compare les séquences d'ADN (ou de protéines) en réalisant des "alignements de séquences".
    Et je suis quelqu'un d'averti sur le sujet.

    Cordialement,
    piwi
    Je sers la science et c'est ma joie.... Il parait.

  7. #6
    invite71f23525

    Re : Terme scientifique pour comparaison des séquences d'ADN

    Vu que tu es un grand sceptique (en science c'est une qualité tant que cela est raisonnable), j'appuie et confirme ce que dit Piwi. Il n'y a pas forcément un terme pour chaque concept ou méthode biologique, et cela est vrai pour tout. Voici un site web de Pasteur proposant des outils bioinformatiques : http://bioweb.pasteur.fr/ qui montre qu'il n'y a pas de terme pour parler de comparaison de séquences d'ADN, on parle directement d'alignements.

    Greg

  8. #7
    invite25217b75

    Re : Terme scientifique pour comparaison des séquences d'ADN

    Et bien merci beaucoup Cela m'enlève un poids !

    PS : je ne mettais pas en doute votre savoir sur le sujet j'aime bien varier mes sources

  9. #8
    gorben

    Re : Terme scientifique pour comparaison des séquences d'ADN

    Salut,
    Vu que la question vient directement apres celle sur le sequencage et juste avant une question sur les limitations, on pourrait aussi parler de "contig" plutot que d' "alignement de sequence"...
    A+

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