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analyse puce ADN



  1. #1
    aline555

    analyse puce ADN

    bonjour,
    j'ai des résultats de puce adn sur une bacteries gram -, et ni moi ni mon équipe avons de l'expertisse sur le sujet. et j'ai enormement de gene qui bouge, pour l'instant je regarde ce qui bouge le plus (en FC); mais j'aimerais avoir une analyse plus global. quand je regardes les publi je vois qu'ils groupent les genes selon leur fonctions (metabolic, struture ou autres) et j'aimerais faire ca, on m'a dit que c'est possible sur ecocyc (m^me si ce n'est pas une coli, mais assez proche) ou keg, mais je ne sais pas plus, est ce que quelqu'un pourrait m'indiquer une méthode?

    Merci d'avance

    -----


  2. #2
    4Ur[3]L

    Re : analyse puce ADN

    L'analyse des puces à ADN est relativement complexe, surtout si l'on ne s'y connait pas du tout. On retrouve par exemple une normalisation des données (essentiel), la détermination d'un seuil, le clustering (le plus souvent), l'annotation des gènes, ...

    De nombreuses plateformes bioinformatiques existent et proposent ce genre de services, ainsi que des formations.
    Je pense que c'est le meilleur moyen pour obtenir une expertise professionnelle et des résultats intéressants.

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