acides aminés et structures

[invite79c95ea2]

Bonjour,
Peut-on deduire la structure II(hélice alpha, feuillet beta..) ou III (repliement ) d'une protéine à partir d'une séquence d'acides aminés (structure I) ?
Merci
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[invitedcfa2657]

Oui, en connaissant les propriétés physico-chimiques des acides aminés on peut, pour peu qu'on ait les connaissances adéquates, prédire de quelle manière va s'agencer la suite d'AA's dans l'espace. Hydrophobicité, Hydrophilicité, etc sont des exemples de propriétés sur lesquelles on peut se baser

En tout cas, c'est ce que mon Professeur Doctorant de Biochimie universitaire nous rappelle souvent ^^

[invite2fb83916]

Bien sûr! Des outils bio-informatiques existent permettant de prédire les structures secondaires et tertiaires probables de séquences peptidiques. Ils permettent même de visualiser les modifications de ces structures impliquées par exemple lors de mutations.

[invitef93eb190]

Théoriquement, la réponse est OUI.
Mais dans la réalité, c'est NON, ou plutôt PAS TOUT A FAIT...

En fait, il s'agit d'un grand domaine de recherche en bioinformatique.
On arrive à peu près correctement à prédire les structures IIaires des protéines, mais pour les structures IIIaires, c'est beaucoup plus difficile. Et en fait, on ne prédit pas vraiment la structure, on essait de trouver parmi les structures que l'on connait déjà, lesquelles pourraient correspondre à la séquence donnée.

Je crois que les meilleures méthodes (actuelles) permettant de prédire la structure 3D des protéines trouvent environ 70% (grand max) de la structure "réelle" (comme elle serait réellement dans les cellules)...
Donc c'est pas encore gagné. Le plus difficile à prédire, ce sont les boucles et les extrémités de la protéine principalement.

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[A voir en vidéo sur Futura]

[invite4ae3ed6a]

Je pense aussi à l'outil informatique, il y a des portail dédié à la structure 3 D de la protéine ...